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代谢组学的生物信息挖掘,代谢组学的生物信息挖掘包括

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  1. 代谢组学的研究方法

1、代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰,最终了解不同化合物的结构,建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。

先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。

代谢组学的研究方法与蛋白质组学有相似之处,主要包括两种策略:代谢物指纹分析(metabolomic fingerprinting)和代谢轮廓分析(metabolomic profiling)。指纹分析利用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术,通过比较不同个体血样中代谢产物的质谱峰,识别并构建一套能识别不同化合物特性的分析体系。

研究中药这种复杂混合物的毒性,代谢组学是最好的方法,选择不同产地、不同数量、不同组分的中药,做出代谢组图,根据组成变化与毒性、药效相对应,就可把有效的成分最大化,把有毒的东西剔除。同样,代谢组学也是中药质量控制的主要研究手段,有利于中药的出口和国际化。

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