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转录组学与代谢通路(转录组测序可知道代谢通路么)

转录组学与代谢通路(转录组测序可知道代谢通路么)

大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于转录组学与代谢通路的问题,于是小编就整理了1个相关介绍转录组学与代谢通路的解答,让我们一起看看吧。

  1. 转录组分析怎样寻找代谢通路基因

1、转录组分析怎样寻找代谢通路基因

分析转录组学中的gene:转录组测序可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但由于基因与表型难以直接关联,导致关键信号通路难以确定,因此往往达不到预期研究目的。代谢物是基因型与表型之间的桥梁,代谢物的变化更能直接揭示基因的功能,因此能够更有效地揭示生物学及其生化、分子机理。

基因组学和转录组学:利用全基因组测序和转录组测序(RNA-seq)来识别未知基因和潜在的调控元件。对比不同条件(如应激、药物处理、疾病状态等)下的表达数据,以找出可能涉及新通路的基因 蛋白质组学:通过研究蛋白质的表达、相互作用和修饰,可以识别出新的蛋白质通路和信号转导过程。

iPath中可以使用Compounds、Pathways、Orthologousgroups、Modules、Enzymes和Reactions等多种名称进行搜索,以查找感兴趣的部分通路及其关系。在转录组研究中,可以将分析得到的基于KEGG数据库注释的差异表达基因结果导入iPath,从而绘制特异性的差异通路图。

生成的代谢通路结果按数量排序,点击通路链接,可以查看该通路中哪些基因上调,哪些基因下调。掌握此方法后,您可以在几分钟内独立完成任意差异基因列表的KEGG注释图,无需依赖公司服务。

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