三个物种之间代谢组学(简述三大类物质代谢间的关系)
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1、代谢组学如何结合16S 测序与宏基因组测序
测序结果显示不同疾病状态下菌群是否有显著差异;16S 扩增子测序比较细菌差异表达谱,微生物代谢产生特定代谢物的通路上关键基因丰富度是否发生变化;为了验证代谢通路变化得出来的结论,进行代谢物检测,印证宏基因分析出来的代谢通路是否真的在下游代谢产物上存在差异。
代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。
代谢组学研究同样重要,如1H-NMR波谱在环境影响下的代谢分析(第九章)。在基因组突变检测方面,包括限制性酶切标记基因组扫描(第十章),彗星实验(第十一章)以及荧光原位杂交探测染色体变异(第十三章)。
与基因组学专注于基因层面的研究,蛋白质组学关注蛋白质活动,代谢组学则更深入地探究细胞内部的生命活动,如细胞信号传递和能量转换等,这些都是由代谢物调控的。代谢组,即生物或细胞在特定生理状态下所有低分子量代谢产物的集合,是代谢组学的研究对象。
人类宏基因组学的主要研究方法是利用高通量测序技术对宏基因组进行测序,并通过处理、分析等步骤来获得微生物组和宿主组的相关数据,如微生物分类和数量、微生物代谢产物、代谢组学数据等,以及宿主基因组的变异和表达等信息。
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