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1. 如何利用代谢组学结果画代谢通路

1、如何利用代谢组学结果画代谢通路

结果表明，调整水相/有机相的比例对于两相分离非常重要。同时水相pH 值对提取的代谢物数量也有很大影响，为了提取尽可能多的代谢物，需要采用多个pH 值进行提取。

代谢物提取，一般要求每组至少10个样；在所有提取好的样本中取等量混合作为QC；QC样本与实验样本穿插上机，开始十个QC，结尾三个QC，中间每十个样本穿插一个QC样本。这里我们采用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析（GSEA）是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。

在众多软件中，Metaboanalyst作为免费的选择，提供数据预处理和统计分析的强大支持，如缺失值处理和归一化，同时还能进行代谢通路分析。MS-DIAL则专为非靶向数据设计，处理各类质谱数据，以PCA和PLS-DA等方法揭示数据背后的故事。数据分析的每一步，从数据清洗到代谢物选择，再到深入解释，都要求严谨与精细。

代谢物统计学差异分析及生物信息学分析 本部分分析内容与常规代谢组学一致，主要针对代谢物含量开展单维与多维统计学分析、KEGG通路分析、表达量相关性分析、聚类热图、代谢物分类等分析。

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