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代谢组学重编码(代谢组学验证)

代谢组学重编码(代谢组学验证)

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  1. 【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合

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这里我们采用基于秩的检验方法,其中基因集富集分析(GSEA)是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子,它也可以应用于代谢组数据。使用GSEA或OR分析的途径分析也可以通过结合代谢组学和转录组学数据来进行,好处是从这两种数据类型中收集信息以确定代谢途径富集程度。

代谢组学隶属于组学范畴之内,目前关注度颇高,它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术,可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析,并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。然而,代谢组学涉及到的技术原理相对比较广泛,运用的技术手段不同,原理也略有不同。

代谢组学,一个源自基因组学与蛋白质组学理念的领域,主要致力于对生物体内所有小分子代谢物(相对分子质量通常小于1000)进行定量分析。这一研究方法的核心目标是揭示代谢物与生物体生理病理状态之间的复杂关联,从而深化我们对生物系统动态的理解,它是系统生物学研究的重要组成部分。

代谢物提取,一般要求每组至少10个样;在所有提取好的样本中取等量混合作为QC;QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本。这里我们采用基于秩的检验方法,其中基因集富集分析(GSEA)是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子,它也可以应用于代谢组数据。

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