血液代谢组学有什么,血液代谢组学分析
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1、代谢组学细胞样本收集
代谢组学方法已广泛用于动物和植物组织、酵母和细菌,针对不同的组织和细胞类型开发了不同的样品收集技术。
离心:将血液样本在4°C下进行离心(例如,3000 g,10分钟),以分离血浆或血清。血浆:抽血后,立即在4°C下离心(例如,3000 g,10分钟)以分离血浆。血浆位于管子顶部,应小心转移以避免扰动红细胞。
代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。
收集细胞没收集完全细胞会导致细胞破碎从而影响代谢组学分析过程。细胞不同于其他的样本,它的代谢物丰富但含量较低且不易收集或收集不完全,因此需要一种有效可靠的处理方法来获得更为全面的代谢物信息。
2、代谢组学的研究方法
代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。
一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。
先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。
研究中药这种复杂混合物的毒性,代谢组学是最好的方法,选择不同产地、不同数量、不同组分的中药,做出代谢组图,根据组成变化与毒性、药效相对应,就可把有效的成分最大化,把有毒的东西剔除。
3、代谢组学分析是干嘛的
“靶向代谢组学”(targeted metabolome)的目的则是定量验证特定代谢产物的表达差异。
代谢组学隶属于组学范畴之内,目前关注度颇高,它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术,可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析,并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。
概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。
代谢组学是对代谢组学的研究,而代谢组学是对特定生物体对致病性刺激或基因修饰的多参数代谢反应的研究。NMR对于物质结构的指认要比MS更精确(异构体)对定性非常有用,成为非靶向代谢组学的重要方向。
代谢组学是基因组学、转录组学和 蛋白质组学 的下游补充,提供生物系统生理状态的总体评估。它代表了遗传调节的终点及其对细胞中酶活性和内源性生化反应变化的影响。
4、做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理
基于超高效液相色谱-质谱联用技术的非靶向代谢组学分析流程一般包括: 样品的收集和预处理、代谢物提取、LC-MS全扫描检测、数据预处理、统计分析及差异物结构鉴定。
代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。
代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本 。
根据样本或分组内缺失值的比例,进行数据过滤是代谢组学分析中常用的方法。缺失值填充 对于未被过滤的缺失值,如果直接忽视,这样的数据矩阵可能会影响后续算法的计算,将会触发异常。
红外(IR)光谱:通过IR光谱分析,可以获得代谢物中功能团的信息。以上方法可以单独使用,也可以结合使用。
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