转录组联合代谢组学-转录组和代谢组关联分析
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1、生物组学的概念?
生命大数据
生命是这个世界重要的组成部分,生命活动是通过生物作为载体形成的,在生物学和统计学上这样的生物体称之为生物样本。生物样本在生命活动中产生大量的数据,主要包括生物体数据和行为数据。生物体数据是指单个样本或者群体样本贯穿整个时间和空间形成的生物组学数据和生物样本元数据,是对生物体样本在客观世界的描述。其中生物组学数据沿着中心法则的转化依此形成:基因组数据、转录组数据、表观组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、时空组数据等,组学数据从根本上解释了生物体的生物学过程。生物元数据常被称为表型数据,是描述生物样本的元数据,没有明确的边界,只要是有意义的、可描述的、可量化的属性就行,主要反映一个样本的某种存在形式和状态。生物样本数据可以从生态、群体、个体、组织等宏观角度来观测,也可以从细胞、分子等微观角度来采集,同时在不同观测角度上又具有组份、结构、顺序等描述维度。
在分子生物学中,组学主要包括基因组学、蛋白组学代谢组学、转录组学、脂类组学,免疫组学、糖组学和RNA组学学等。
通过对基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据进行整合分析,可以了解目标样本内基因、RNA、蛋白质和代谢产物的基本状态,从而对生物系统进行全面解读。
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