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1. 简述代谢组学的概念、研究技术和应用
2. 代谢组学的学科归类
3. 第04周-用LC-MS来找HCC的代谢标记物
4. 代谢组学的研究方法和研究流程

1、简述代谢组学的概念、研究技术和应用

代谢组学 ：利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。代谢组学应用：PS：TIC是在GC-MS或LC-MS等方法中使用的一种色谱图。

概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

植物营养研究：代谢组学可以用于研究植物对不同营养元素的吸收和利用，为合理施肥提供科学依据。植物药用价值研究：通过分析植物中的代谢物，可以评估其药用价值，为中药开发提供参考。

代谢组学隶属于组学范畴之内，目前关注度颇高，它是了解小分子代谢物质（相对分子质量小于1000）数量、种类、丰度的研究技术，可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析，并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。

2、代谢组学的学科归类

代谢组学是上世纪九十年代中期发展起来的一门新兴学科，是系统生物学的重要组成部分。它是关于生物体系内源代谢物质种类、数量及其变化规律的科学，研究生物整体、系统或器官的内源性代谢物质及其所受内在或外在因素的影响。

代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。

代谢组学是研究生物体内代谢产物的种类、分布和变化规律的学科。生物信息学在代谢组学中的应用主要包括代谢物鉴定、通路分析和代谢物组学等方面。

代谢组学是研究生物体内所有代谢物的科学，它在植物研究中有着广泛的应用。

基因组学-功能基因；蛋白质组学-差异蛋白；转录组学-RNA量变；代谢组学-次生代谢物。

3、第04周-用LC-MS来找HCC的代谢标记物

液质联用（LC/MS）： LC为液相色谱仪；MS为一种能够生成离子，在气态中根据质荷比的不同将其分离并进行检测的仪器。 LC/MS以液相色谱作为分离系统，质谱作为检测系统， 因而兼具有液相色谱高分离度与质谱高灵敏度的特点。

不一定。肿瘤标记物是指基于肿瘤细胞的生物化学性质及其代谢异常，使得肿瘤病人的体液、排泄物及组织中某些物质产生了质或量的改变。具体到CA19-9，是胆囊癌、胰腺癌、肠癌等消化道肿瘤的辅助诊断指标。

疾病严重度标记物（burden ofdiseasemarkers）主要评估OA的严重程度或累及范围，特别是某一时间点的疾病情况。

Wald认为PAPP-A和游离β-hCG是最能区别唐氏综合征与正常胎儿的血清标记物。49%的唐氏综合征胎儿母体血清PAPP-A低于第5百分位数。

4、代谢组学的研究方法和研究流程

先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。

代谢组学的研究方法：代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品（如尿液、血液、组织、细胞和培养液等）采集后进行生物反应灭活、预处理。

一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。

代谢组学和中医中药的哲学观相吻合，代谢组学是研究中药最好的选择。

基于超高效液相色谱-质谱联用技术的非靶向代谢组学分析流程一般包括： 样品的收集和预处理、代谢物提取、LC-MS全扫描检测、数据预处理、统计分析及差异物结构鉴定。

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