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关于代谢组学数据处理的ppt,代谢组学数据处理方法

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  1. 非靶向 | 靶向代谢组学数据分析总结-纲要
  2. 深度空间代谢组学QA(三)| 常规分析内容及数据清洗策略
  3. 医学大数据分析策略与数据挖掘PPT课件

1、非靶向 | 靶向代谢组学数据分析总结-纲要

代谢组学分析如下:代谢组学研究可分为两类:“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。

靶向代谢组学新技术,区别于传统的非定向代谢组学,具有如下优势:样品种类多:生物流体(血液、尿、唾液、肠道微生物)、环境样品、细胞、动植物组织、污水、药品、食品。

拟靶向代谢组学主要包括三个步骤:(1)基于四极杆飞行时间质谱的非靶向分析;(2)母离子/产物离子对的选择及检测参数优化;(3)使用三重四极杆或QTRAP质谱采用MRM模式(包括上述离子对)对样品进行分析。

新污染物的鉴别是一个复杂的过程,非靶向识别流程是其常用的方法之一。下面是新污染物非靶向识别流程的第一步:采集样品:从可能存在新污染物的环境中采集样品,如水体、土壤、空气等。

2、深度空间代谢组学QA(三)| 常规分析内容及数据清洗策略

空间聚类分析(Segmentation)空间聚类分析的本质是一张空间聚类分析的热图,通过聚类算法后,对有相似代谢模式的区域使用同一种颜色标注,清晰直观的从分子层面对切片进行区域分型。

代谢组学(metabonomics/metabolomics)是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。

公司介绍:苏州帕诺米克(BioNovoGene)最早是做基因检测服务的,2017左右聚焦做代谢组学,改名为诺米代谢(PanoMIX),公司2021年获得元生创投亿级融资。

基因编辑:基因编辑技术,特别是CRISPR-Cas9技术,已成为生命科学领域的一个重要工具。它可以准确地更改基因序列,对于治疗遗传性疾病、创新农业生产和研究动植物等领域都具有巨大的潜力。

深度学习在处理高维基质转录组学数据方面也取得了一些成功。

3、医学大数据分析策略与数据挖掘PPT课件

https://pan.baidu.com/s/1Z2GJ4gbpx6R3xeH3xgmc6Q 提取码:1234 《大数据分析与数据挖掘》是2016年清华大学出版社出版的图书,作者是简祯富、许嘉裕。

它是通过分析每个数据,从大量数据中寻找其规律的技术,主要有数据准备、规律寻找和规律表示3个步骤。

分析更多依赖于业务知识,数据挖掘更多侧重于技术的实现,对于业务的要求稍微有所降低,数据挖掘往往需要更大数据量,而数据量越大,对于技术的要求也就越高需要比较强的编程能力,数学能力和机器学习的能力。

描述型分析:最常见的分析方法。在业务中,这种方法向数据分析师提供了重要指标和业务的衡量方法。例如,每月的营收和损失账单。数据分析师可以通过这些账单,获取大量的客户数据。

大数据分析与挖掘技术涵盖了多个领域和多种工具,以下是一些常见的技术和方法:数据预处理:包括数据清洗、转换、合并、格式化等,是进行数据分析之前的重要步骤。

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