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1. 如何看待代谢组学的前景
2. “基因组”“蛋白组”“转录组”“代谢组”的异同?
3. 代谢组学的研究方法

1、如何看待代谢组学的前景

Siuzak博士认为，代谢组学研究最大的挑战就在于对代谢产物的识别，这也是最有趣的方面，而更具挑战性的工作，是进一步确认所有代谢物的功能。

代谢组学和中医中药的哲学观相吻合，代谢组学是研究中药最好的选择。

代谢组作为系统生物学的重要组成部分，在临床医学领域具有广泛的应用前景。代谢产物是基因表达的最终产物，在代谢酶的作用下生成。

特别是基因组的研究取得重大突破后，正深入到后基因组学时代，通过功能基因组学和比较基因组学的研究，对基因、细胞、遗传、发育、进化和脑功能的探索正在形成一条主线。

代谢组学（metabonomics/metabolomics）是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

2、“基因组”“蛋白组”“转录组”“代谢组”的异同?

组学omics，研究的是整体. 按照分析目标不同主要分为基因组学，转录组学，蛋白质组学，代谢组学。基因组学研究的主要是基因组DNA，使用方法目前以二代测序为主，将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。

比较形象的解释：基因组学反映了什么是可以发生的，转录组学反映的是将要发生的，蛋白质组学指出了赖以发生的， 代谢组学反映已经发生的。

四大组学是指基因组学、蛋白质组学、代谢组学和转录组学。基因组学：通过DNA芯片或高通量测序技术对大规模基因组数据进行分析，从而找出与疾病相关的遗传变异及其基因表达情况。

转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA（包括mRNA，smallRNA及non-coding RNA等）的总和。

3、代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法：代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品（如尿液、血液、组织、细胞和培养液等）采集后进行生物反应灭活、预处理。

一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。

先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。

研究中药这种复杂混合物的毒性，代谢组学是最好的方法，选择不同产地、不同数量、不同组分的中药，做出代谢组图，根据组成变化与毒性、药效相对应，就可把有效的成分最大化，把有毒的东西剔除。

“靶向代谢组学”（targetedmetabolome）的目的则是定量验证特定代谢产物的表达差异。

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