代谢组学是新方法吗,代谢组学的定义
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1、代谢组学的介绍
代谢组 :一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。代谢组学 :利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。
代谢组学(metabonomics/metabolomics)是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。
代谢组学是对一系列相似的生物样本中的代谢物进行比较分析的学科。代谢物在生物系统中起着至关重要的作用,因此代谢组学可用于发现和鉴定生物标志物,或更好地了解药物或疾病对已知和未知生物通路的影响。
代谢组学分析一般要求数据为正态分布或者高斯分布,数据通常需要进行Log转化。Log转化可以矫正数据集的异方差性,减少或消除数据结构的不对称性,提高数据结构的正态分布性。
2、代谢组学的发展前景
代谢组学是继基因组学、蛋白质组学、转录组学后出现的新兴“组学”,自1999年以来,每年发表的代谢组学研究的文章数量都在不断增加。从表面上看,代谢组学的发展很迅速,但是仍然远远落后于基因组学和蛋白质组学。
代谢组作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有广泛的应用前景。代谢产物是基因表达的最终产物,在代谢酶的作用下生成。
经过十几年的发展,代谢组学不仅在基因功能鉴定及生物系统研究等方面发挥着重要作用,而且在中医药领域也得到了广泛的应用。
特别是基因组的研究取得重大突破后,正深入到后基因组学时代,通过功能基因组学和比较基因组学的研究,对基因、细胞、遗传、发育、进化和脑功能的探索正在形成一条主线。
围绕快速、有效地发现分子和标志物这一目的,精准和高通量正成为引领发展的方向。
3、如何看待代谢组学的前景
Siuzak博士认为,代谢组学研究最大的挑战就在于对代谢产物的识别,这也是最有趣的方面,而更具挑战性的工作,是进一步确认所有代谢物的功能。
代谢组学和中医中药的哲学观相吻合,代谢组学是研究中药最好的选择。
代谢组作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有广泛的应用前景。代谢产物是基因表达的最终产物,在代谢酶的作用下生成。
特别是基因组的研究取得重大突破后,正深入到后基因组学时代,通过功能基因组学和比较基因组学的研究,对基因、细胞、遗传、发育、进化和脑功能的探索正在形成一条主线。
4、代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?
“代谢组学”是一种整体性的研究策略,其研究策略有点类似于通过分析发动机的尾气成分,来研究发动机的运行规律和故障诊断等的“反向工程学”的技术思路。
概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。
代谢组学是研究生物体内所有代谢物的科学,它在植物研究中有着广泛的应用。
“靶向代谢组学”的研究对象是确定的一种或几种代谢产物,并用大量的试验样本进行验证,由于要进行定量研究,有可能会使用内标来制定标准曲线(绝对定量)。
代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。
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