1.  > 代谢组学

代谢组学经典方案设计(代谢组学一般研究方法及步骤)

代谢组学经典方案设计(代谢组学一般研究方法及步骤)

大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于代谢组学经典方案设计的问题,于是小编就整理了5个相关介绍代谢组学经典方案设计的解答,让我们一起看看吧。

  1. 用代谢组学「语言」诠释中医药内涵
  2. 做好代谢组学研究的关键在哪里?
  3. 代谢组学的研究方法
  4. 代谢组学中有些数据是相反的怎么办
  5. 7.多关联双亲染色体片段代换系(CSSL)群体的代谢组分析

1、用代谢组学「语言」诠释中医药内涵

植物代谢组学技术具有整体分析的能力,符合中医药整体观理论能够反映外源性物质对生物体产生的整体性效应,适用于中药等复杂体系的分析等优势。

代谢组学创始人、英国帝国理工大学Jeremy Nicholson教授认为人体应该作为一个完整的系统来研究,应用代谢组学来理解疾病过程,与中医的整体观和辨“证”论治思维方式不谋而合。

时下热门的代谢组学分析认为,中药成分对生物体代谢网络的扰动作用可能是直接作用于核受体-代谢酶系统,也可能影响其他病理环节、信号通路从而间接调控代谢,还可以通过肠道菌群影响机体的系统代谢网络。

数量及其变化规律的科学,研究生物整体、系统或器官的内源性代谢物质及其与内在或外在因素的互作。“代谢组学”已成为运用系统生物学研究中医药的重要手段,还可能成为我国传统医学走向国际化的通用语言。

中医药对疫病理论的认识也有提升。总结新冠肺炎病例的特点,借助现代科技手段,包括代谢组学的手段,快速筛选包括“三药三方”在内的一批方药,供给临床使用。各个部委近两年密切出台了一系列扶持发展中医药的政策。

2、做好代谢组学研究的关键在哪里?

研究代谢组学的关键是要发展大规模、并行化测定复杂混合体系中代谢物组成信息和对大量数据进行分析和建模的能力。技术手段的发展是代谢组学发展的关键因素。

代谢组学在茶叶研究中的应用主要有品质鉴定、生理生化过程、功能性成分分析。品质鉴定 通过分析茶叶中代谢产物的种类和含量,鉴定茶叶的品质、产地、品种。不同地区的茶叶具有的独特的香气和口感,与代谢产物的组成密切相关。

植物营养研究:代谢组学可以用于研究植物对不同营养元素的吸收和利用,为合理施肥提供科学依据。植物药用价值研究:通过分析植物中的代谢物,可以评估其药用价值,为中药开发提供参考。

代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。 代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。

3、代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。

先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。

研究中药这种复杂混合物的毒性,代谢组学是最好的方法,选择不同产地、不同数量、不同组分的中药,做出代谢组图,根据组成变化与毒性、药效相对应,就可把有效的成分最大化,把有毒的东西剔除。

4、代谢组学中有些数据是相反的怎么办

如果你的存储系统有权限管理,需要在格式转换之前,将需要转换的目录权限修改为777,否则proteowizard无法访问和写入数据。

代谢物提取,一般要求每组至少10个样;在所有提取好的样本中取等量混合作为QC;QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本。

数据归一化 数据归一化是将数据映射到特定范围之内再进行处理,有利于便捷快速的运算。数据归一化是数据预处理重要一步,可消除样本处理、浓度差异、仪器偏差等统误差。

代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

使用平台特定的方法对转录组和代谢组数据进行预处理和质控。 将代谢物标识符分配给轮廓代谢物,然后可以将其映射到生物途径。

5、7.多关联双亲染色体片段代换系(CSSL)群体的代谢组分析

本文以三个具有共同轮回遗传背景的染色体片段代换系群体的剑叶为材料,对水稻的代谢多样性进行了分析。

为了剖析荔枝果实成熟的调控网络,文章使用72个种质进行了全基因组关联分析(GWAS),发现一个开花相关基因(LITCHI019307)在荔枝中具差异表达。

这里有一包含 65 个染色体片段置换系( chromosome segment substitution line , CSSL) 的群体 ,产生这一群体的 2 个亲本分别为粳稻 Asominori(背景或轮回亲本) 和籼稻 IR24 (供体或非轮回亲本)。

国内有报道用人类原癌基因Ha-ras-1为探针,对精神病患者基因组进行限止性片段长度多态性的分析,结果提示11号染色体上可能存在着精神分裂症与双相情感性精神病有关的DNA序列。

到此,以上就是小编对于代谢组学经典方案设计的问题就介绍到这了,希望介绍关于代谢组学经典方案设计的5点解答对大家有用。

[免责声明]本文来源于网络,不代表本站立场,如转载内容涉及版权等问题,请联系邮箱:3801085100#qq.com,#换成@即可,我们会予以删除相关文章,保证您的权利。 转载请注明出处:http://www.mxzdyx.cnhttp://www.mxzdyx.cn/jlb/2305.html