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代谢组学属于宏组学吗(代谢组学——方法与应用)

代谢组学属于宏组学吗(代谢组学——方法与应用)

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  1. 代谢组学的学科归类
  2. 组学是什么意思?
  3. 组学的定义及组学如何分类?
  4. 【代谢组学】现代仪器分析技术—代谢组学技术基础及原理

1、代谢组学的学科归类

代谢组学是上世纪九十年代中期发展起来的一门新兴学科,是系统生物学的重要组成部分。它是关于生物体系内源代谢物质种类、数量及其变化规律的科学,研究生物整体、系统或器官的内源性代谢物质及其所受内在或外在因素的影响。

代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。

代谢组学是研究生物体内代谢产物的种类、分布和变化规律的学科。生物信息学在代谢组学中的应用主要包括代谢物鉴定、通路分析和代谢物组学等方面。

代谢组学是研究生物体内所有代谢物的科学,它在植物研究中有着广泛的应用。

基因组学-功能基因;蛋白质组学-差异蛋白;转录组学-RNA量变;代谢组学-次生代谢物。

2、组学是什么意思?

-omics就是“组学”的意思,transcriptomic即transcript omic,转录组学,研究整个转录组(即全部mRNA)的学科。

“组学”就是从整体水平上以全局眼光对机体的生命活动规律进行研究,“多组学”就是将两个及以上的单一组学联合起来进行全面综合分析。

人类微生物组学计划是继人类基因组计划之后开始的又一重大国际基因组测序计划,其目标是把人体内共生微生物群的基因组序列信息测定出来,而且要研究与人体发育和健康有关的基因功能。

影像组学指高通量地提取大量描述肿瘤特征性的影像特征,最初译为放射组学。放射组学应用大量的自动化数据持征化法将感兴趣区域的影像数据转化为具有高分辨率的可发的特征空间数据。

基因组学、转录组学、蛋白质组学与代谢组学等一同构成系统生物学的组学(omics)生物技术基础。

3、组学的定义及组学如何分类?

常见的组学包括基因组学(研究基因组DNA的组成和功能)、转录组学(研究转录过程中产生的RNA的表达和调控)、蛋白质组学(研究蛋白质的组成、调控和相互作用)和代谢组学(研究生物体内代谢物的组成和变化)。

组学omics,研究的是整体. 按照分析目标不同主要分为基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学。基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。

“多组学”是相对于单一组学如基因组、蛋白质组、代谢组、脂质组、糖组和转录组等而言的。

四大组学是指基因组学、蛋白质组学、代谢组学和转录组学。基因组学:通过DNA芯片或高通量测序技术对大规模基因组数据进行分析,从而找出与疾病相关的遗传变异及其基因表达情况。

基因组学分类的概念最早于1986年由美国遗传学家Thomas H. Roderick提出。基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。

4、【代谢组学】现代仪器分析技术—代谢组学技术基础及原理

代谢组学隶属于组学范畴之内,目前关注度颇高,它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术,可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析,并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

代谢组学分析如下:代谢组学研究可分为两类:“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。

代谢组学在茶叶研究中的应用主要有品质鉴定、生理生化过程、功能性成分分析。品质鉴定 通过分析茶叶中代谢产物的种类和含量,鉴定茶叶的品质、产地、品种。不同地区的茶叶具有的独特的香气和口感,与代谢产物的组成密切相关。

靶向代谢组学新技术,区别于传统的非定向代谢组学,具有如下优势:样品种类多:生物流体(血液、尿、唾液、肠道微生物)、环境样品、细胞、动植物组织、污水、药品、食品。

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