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代谢组学富集分析效果不显著-代谢组学结果分析

代谢组学富集分析效果不显著-代谢组学结果分析

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  1. 代谢组学分析的代谢物质和化学分析法的区别
  2. 代谢组学中如何判定显著相关物质
  3. 代谢物富集分析的目的
  4. 代谢组学的研究方法

1、代谢组学分析的代谢物质和化学分析法的区别

代谢组学是对代谢组学的研究,而代谢组学是对特定生物体对致病性刺激或基因修饰的多参数代谢反应的研究。NMR对于物质结构的指认要比MS更精确(异构体)对定性非常有用,成为非靶向代谢组学的重要方向。

研究生物体整体或组织细胞系统的动态代谢变化,特别是对内源代谢、遗传变异、环境变化乃至各种物质进入代谢系统的特征和影响的学科。

化学方法和仪器方法是相辅相成的。在使用时应根据具体情况,取长补短,互相配合。学习掌握的目标不同:化学分析主要的内容为:数据处理与误差分析、四大滴定分析法、重量分析法。

代谢组学研究可分为两类:“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。

组学omics,研究的是整体. 按照分析目标不同主要分为基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学。基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。

2、代谢组学中如何判定显著相关物质

一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。

负荷图:负荷图可以帮助理解哪些变量(代谢物)对主成分的贡献最大。进一步的数据分析:统计验证:进行统计测试,如ANOVA或t检验,以验证PCA结果的统计显著性。

代谢组学隶属于组学范畴之内,目前关注度颇高,它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术,可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析,并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

蛋白质组学:通过质谱、免疫印迹等技术鉴定疾病状态下不同样本(如血清、组织等)中蛋白质表达差异,找出与疾病相关的蛋白质标志物。

3、代谢物富集分析的目的

代谢物在生物系统中起着至关重要的作用,因此代谢组学可用于发现和鉴定生物标志物,或更好地了解药物或疾病对已知和未知生物通路的影响。成功的代谢物组学研究依赖于有效的代谢物提取。

概念不同:富集分析是一种广泛应用于生物信息学研究的统计方法,主要用于检验一个基因集合中某些功能或特征的富集程度;通路分析则是找到基因表或目标基因表所显著性富集的通路。

富集分析(Enrichment Analysis) 是一种广泛应用于 生物信息学Q 研究的统计方法,主要用于检验一个基因集合中某些功能或特征的富集程度。富集分析的主要目的是从大量基因数据中找出有生物学意义的模式和功能。

代谢组学分析如下:代谢组学研究可分为两类:“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。

4、代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。

先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。

研究中药这种复杂混合物的毒性,代谢组学是最好的方法,选择不同产地、不同数量、不同组分的中药,做出代谢组图,根据组成变化与毒性、药效相对应,就可把有效的成分最大化,把有毒的东西剔除。

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