代谢组学代谢途径怎么画-代谢组原理

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如上图所示，每一列代表一个样本，每一行代表一个基因，颜色代表表达量（这张图的图例看出，颜色越偏红色，数值越大，基因表达量越高）。热图还可用于展示其他物质的丰度，如某细菌的相对丰度、代谢组不同物质的含量。

分宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和。

宏基因组和宏转录组中的生物功能在有很高的一致性【下图】；4）个体间的稳定性：宏基因组宏转录组微生物群落；5）多数基因在RNA水平上的变异 DNA水平上的变异。

[代谢组学与 16S 的检测主要是物种类别或者丰度与代谢产物丰度的关联。而宏基因组与代谢组学的关联主要是其代谢通路与基因功能和代谢产物的关联。

有氧呼吸的全过程，可以分为三个阶段：第一个阶段（称为糖酵解），一个分子的葡萄糖分解成两个分子的丙酮酸，在分解的过程中产生少量的氢（用[H]表示），同时释放出少量的能量。

植物呼吸的代谢途径包括有氧呼吸和无氧呼吸，其中无氧呼吸又包括两种类型，分别为酒精发酵和乳酸发酵。

EMP-TCA循环是植物体内有机物氧化分解的主要途径，而PPP等途径在呼吸代谢中也占有重要地位。呼吸底物彻底氧化，最终释放CO2和产生水，同时将底物中的能量转化成TP形式的活跃活化能。EMP-TCA循环中只有CO2和少量ATP的形成。

植物产生的氧气来自光合作用的途径光合作用与植物产生氧气光合作用是植物、蓝细菌和某些原生生物使用能量（主要是太阳能）将二氧化碳和水转化为有机物和氧气的过程。

蛋白质组学：通过研究蛋白质的表达、相互作用和修饰，可以识别出新的蛋白质通路和信号转导过程。代谢组学：研究细胞的代谢物和代谢过程，可以发现新的代谢通路。

结果表明，调整水相/有机相的比例对于两相分离非常重要。同时水相pH 值对提取的代谢物数量也有很大影响，为了提取尽可能多的代谢物，需要采用多个pH 值进行提取。

在中心法则的指导下，基因组、转录组、蛋白组通常以信息流的方式呈现，而代谢组被认为是新陈代谢的结果。

代谢物提取，一般要求每组至少10个样；在所有提取好的样本中取等量混合作为QC；QC样本与实验样本穿插上机，开始十个QC，结尾三个QC，中间每十个样本穿插一个QC样本。

主要在线粒体中进行的代谢途径是三羧酸循环。原核生物中分布于细胞质，真核生物中分布在线粒体。

TCA循环与氧化磷酸化无氧酵解发生在胞质中，线粒体是糖、脂肪、和氨基酸最终氧化释放能量的场所。

糖的有氧氧化：葡萄糖在线粒体中经过一系列酶的催化反应，被氧化成丙酮酸，同时释放出大量能量。这一过程被称为糖的有氧氧化，是线粒体中最重要的反应途径之一。

是三羧酸循环，因为在这个循环中几个主要的中间代谢物是含有三个羧基的有机酸，例如柠檬酸（C6），三羧酸循环是三大营养素（糖类、脂类、氨基酸）的最终代谢通路，又是糖类、脂类、氨基酸代谢联系的枢纽。

因此，线粒体只是一种半自主性的细胞器。各种各样的代谢途径几乎都与线粒体有关，主要有糖代谢三羧酸循环，蛋白质合成，脂肪代谢中间体，核苷酸代谢，是糖、脂、蛋白质相互转变的枢纽，参与细胞生命活动的调节。

机体内糖的代谢途径主要有葡萄糖的无氧酵解、有氧氧化、磷酸戊糖途径。葡萄糖的无氧酵解糖酵解可以把释放的自由能转移到ATP中。糖酵解也是果糖、甘露糖、半乳糖等己糖的共同降解途径。

糖在体内分解代谢的主要途径是糖酵解途径、三羧酸循环及氧化磷酸化。其生理意义为为机体供能。

考虑机体生理学需要的有效途径；补充糖酵解的一些正中间物质是长链脂肪酸、碳水化合物等的生成前体，并与别的新陈代谢方式相联络。

②脂肪转变成糖类。脂肪分解产生的甘油和脂肪酸能够转变成糖类。（3）蛋白质代谢与脂肪代谢的关系 ①一般来说，动物体内不容易利用脂肪合成氨基酸。植物和微生物可由脂肪酸和氮源生成氨基酸。

主要来源相同：动物体内的三大营养物质均主要来自食物的消化与吸收。（2）主要代谢途径相同：三大营养物质在体内可合成、分解与转变。（3）都能作为能源物质氧化分解释放能量，最终产物均有和。

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