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1. 代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?
2. 如何找到新的细胞通路
3. 紧急求助,代谢组学的代谢通路富集分析和MYROLE该怎么用
4. 如何利用代谢组学结果画代谢通路

1、代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?

“代谢组学”是一种整体性的研究策略，其研究策略有点类似于通过分析发动机的尾气成分，来研究发动机的运行规律和故障诊断等的“反向工程学”的技术思路。

概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

代谢组学是研究生物体内所有代谢物的科学，它在植物研究中有着广泛的应用。

“靶向代谢组学”的研究对象是确定的一种或几种代谢产物，并用大量的试验样本进行验证，由于要进行定量研究，有可能会使用内标来制定标准曲线（绝对定量）。

代谢组学的研究方法：代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品（如尿液、血液、组织、细胞和培养液等）采集后进行生物反应灭活、预处理。

2、如何找到新的细胞通路

在你将配体作用于细胞后，如果你对这个通路一无所知的话，你可以首先做一个蛋白质组的研究，检测一下阳性组和对照组之间蛋白表达的差异，蛋白磷酸化的差异等等，找出差异之后，在单个验证，利用敲出等技术。

rnaseq这么找通路：KEGG：KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes（KEGG）是一种面向整个基因组的路径数据库，包括有关代谢和细胞过程的通路。

首先打开KEGG数据库，你会进入下面这个界面，点击KEGGPATHWAY。红框标识的是PATHWAY的一级分类，蓝框框住的是二级分类。比如第一个Metabolismpathway的二级pathway已经列出来了。

b.PIP2信号通路：胞外signal 膜受体→PIP2IP3 DAG，IP3→内源钙→细胞溶质，胞内Ca2 浓度升高→启动Ca2 信号系统，DAGCM上活化蛋白激酶PKC→DG/PKC信号传递passwa。

3、紧急求助,代谢组学的代谢通路富集分析和MYROLE该怎么用

对于非靶向代谢组学研究，需要提取细胞和体液中的多种代谢物，并去除无需分析的蛋白质等成分。再加上代谢物的理化性质多样，丰度动辄相差若干数量级，更进一步增加了提取的难度。液液萃取这种两相分离方法常被用于代谢物的提取。

对于非靶向代谢组学研究，需要提取细胞和体液中的多种代谢物，并去除无需分析的蛋白质等成分。再加上代谢物的理化性质多样，丰度动辄相差若干数量级，更进一步增加了提取的难度。液液萃取这种两相分离方法常被用于代谢物的提取。

代谢组学的代谢通路富集分析和MYROLE该怎么用 代谢组学是对一系列相似的生物样本中的代谢物进行比较分析的学科。

液液萃取这种两相分离方法常被用于代谢物的提取，更进一步增加了提取的难度，需要提取细胞和体液中的多种代谢物，丰度动辄相差若干数量级。

4、如何利用代谢组学结果画代谢通路

蛋白质组学：通过研究蛋白质的表达、相互作用和修饰，可以识别出新的蛋白质通路和信号转导过程。代谢组学：研究细胞的代谢物和代谢过程，可以发现新的代谢通路。

结果表明，调整水相/有机相的比例对于两相分离非常重要。同时水相pH 值对提取的代谢物数量也有很大影响，为了提取尽可能多的代谢物，需要采用多个pH 值进行提取。

在中心法则的指导下，基因组、转录组、蛋白组通常以 信息流 的方式呈现，而代谢组被认为是新陈代谢的结果。

代谢物提取，一般要求每组至少10个样；在所有提取好的样本中取等量混合作为QC；QC样本与实验样本穿插上机，开始十个QC，结尾三个QC，中间每十个样本穿插一个QC样本。

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