大家好，今天小编关注到一个比较有意思的话题，就是关于代谢组学QI软件的问题，于是小编就整理了5个相关介绍代谢组学QI软件的解答，让我们一起看看吧。

1. 简述代谢组学的概念、研究技术和应用
2. 代谢组学原始数据格式转换-proteowizard
3. 非靶向 | 靶向代谢组学数据分析总结-纲要
4. 深度空间代谢组学QA(三)| 常规分析内容及数据清洗策略
5. 用matlab如何做代谢组学的主成分分析?

1、简述代谢组学的概念、研究技术和应用

代谢组学 ：利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。代谢组学应用：PS：TIC是在GC-MS或LC-MS等方法中使用的一种色谱图。

概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

植物营养研究：代谢组学可以用于研究植物对不同营养元素的吸收和利用，为合理施肥提供科学依据。植物药用价值研究：通过分析植物中的代谢物，可以评估其药用价值，为中药开发提供参考。

代谢组学隶属于组学范畴之内，目前关注度颇高，它是了解小分子代谢物质（相对分子质量小于1000）数量、种类、丰度的研究技术，可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析，并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。

2、代谢组学原始数据格式转换-proteowizard

proteowizard支持被转换的格式如下：proteowizard有Windows、mac和linux版本。但是对于直接安装的linux版本，没有格式转换的功能。需要转换供应商的（vendor）格式的话，可以使用其安装了window版本（通过wine来执行）的docker镜像。

好在 ProteoWizard 为我们提供了格式转换的工具MSConvert，它可以转换为以下数据格式：MSConvert的Linux版本并不友好，需要wine/docker来运行Proteowizard，但一般linux默认都是x64架构，而x64一直诟病于对Framework的支持。

代谢组学发论文需要原始数据。根据查询相关公开信息显示，代谢组学发论文需要对所写的论文的原始数据进行上传，需要附带在论文中。

生物信息学的应用领域非常广泛，例如基因组学、蛋白质组学、转录组学、代谢组学、系统生物学等。生物信息学的发展也为生物医学研究提供了新的方法和工具，例如在基因诊断、药物设计、疾病预测等方面的应用。

3、非靶向 | 靶向代谢组学数据分析总结-纲要

代谢组学分析如下：代谢组学研究可分为两类：“发现代谢组学”（也称“非靶向代谢组学”）和“靶向代谢组学”。

靶向代谢组学新技术，区别于传统的非定向代谢组学，具有如下优势：样品种类多：生物流体（血液、尿、唾液、肠道微生物）、环境样品、细胞、动植物组织、污水、药品、食品。

拟靶向代谢组学主要包括三个步骤：（1）基于四极杆飞行时间质谱的非靶向分析；（2）母离子/产物离子对的选择及检测参数优化；（3）使用三重四极杆或QTRAP质谱采用MRM模式（包括上述离子对）对样品进行分析。

新污染物的鉴别是一个复杂的过程，非靶向识别流程是其常用的方法之一。下面是新污染物非靶向识别流程的第一步：采集样品：从可能存在新污染物的环境中采集样品，如水体、土壤、空气等。

4、深度空间代谢组学QA(三)| 常规分析内容及数据清洗策略

空间聚类分析（Segmentation）空间聚类分析的本质是一张空间聚类分析的热图，通过聚类算法后，对有相似代谢模式的区域使用同一种颜色标注，清晰直观的从分子层面对切片进行区域分型。

代谢组学（metabonomics/metabolomics）是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

公司介绍：苏州帕诺米克（BioNovoGene）最早是做基因检测服务的，2017左右聚焦做代谢组学，改名为诺米代谢（PanoMIX），公司2021年获得元生创投亿级融资。

基因编辑：基因编辑技术，特别是CRISPR-Cas9技术，已成为生命科学领域的一个重要工具。它可以准确地更改基因序列，对于治疗遗传性疾病、创新农业生产和研究动植物等领域都具有巨大的潜力。

深度学习在处理高维基质转录组学数据方面也取得了一些成功。

5、用matlab如何做代谢组学的主成分分析?

可以使用matlab软件使用主成分分析法。

第一步：选取了8个与城市经济实力密切相关的指标；第二步：对指标进行无量纲化处理（或归一化处理）。根据不同情况采用不同的公式标准化。第三步：进行主成分分析。.采用四次方最大法（Quartimax）进行旋转。

在软件Matlab中实现主成分分析可以采取两种方式实现：一是通过编程来实现；二是直接调用Matlab中自带程序实现。

MATLAB直接用样本实现主成分分析用有多种方式，但是mathwork公司推荐（1）式，因为princomp在使用时调用的是pca，两者的计算结果一样，而且pca多一项explain，更强大。

到此，以上就是小编对于代谢组学QI软件的问题就介绍到这了，希望介绍关于代谢组学QI软件的5点解答对大家有用。