代谢组学的实验流程(代谢组学的检测方法)
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1、代谢组学的研究方法和研究流程
先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。
代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。
一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。
代谢组学和中医中药的哲学观相吻合,代谢组学是研究中药最好的选择。
2、代谢组学分析是干嘛的
“靶向代谢组学”(targeted metabolome)的目的则是定量验证特定代谢产物的表达差异。
代谢组学隶属于组学范畴之内,目前关注度颇高,它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术,可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析,并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。
概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。
代谢组学是对代谢组学的研究,而代谢组学是对特定生物体对致病性刺激或基因修饰的多参数代谢反应的研究。NMR对于物质结构的指认要比MS更精确(异构体)对定性非常有用,成为非靶向代谢组学的重要方向。
代谢组学是基因组学、转录组学和 蛋白质组学 的下游补充,提供生物系统生理状态的总体评估。它代表了遗传调节的终点及其对细胞中酶活性和内源性生化反应变化的影响。
3、代谢组学细胞样本收集
代谢组学方法已广泛用于动物和植物组织、酵母和细菌,针对不同的组织和细胞类型开发了不同的样品收集技术。
离心:将血液样本在4°C下进行离心(例如,3000 g,10分钟),以分离血浆或血清。血浆:抽血后,立即在4°C下离心(例如,3000 g,10分钟)以分离血浆。血浆位于管子顶部,应小心转移以避免扰动红细胞。
代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。
收集细胞没收集完全细胞会导致细胞破碎从而影响代谢组学分析过程。细胞不同于其他的样本,它的代谢物丰富但含量较低且不易收集或收集不完全,因此需要一种有效可靠的处理方法来获得更为全面的代谢物信息。
4、快看,各组学的实验方案,给文章加料!
应用的文献较少,实验思路见参考文献[12]。 实验 材料 总RNA样品或mRNA样本(RNA容易降解,需要注意保存方法及周期) 灵敏度:qRT-PCRNorthern blot,特异性:Nortern blotqRT-PCR(上述已说明实验方案)。
立意要新颖 如果文章主题一般化,不新颖,大家都雷同,就难以写出好文章,所以立意要新颖。好文章的立意应该是“从意中所有,从语中所无”。
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