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1. 代谢组学如何结合16S 测序与宏基因组测序
2. 代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?
3. 简述代谢组学的概念、研究技术和应用

1、代谢组学如何结合16S 测序与宏基因组测序

这里我们采用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析（GSEA）是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。

此外，还需要结合基因组学研究获得的数据。Gary Siuzdak博士在美国克利普斯研究院（TSRI）从事生物信息学问题的研究，他设计了一个分析来自不同样品代谢产物变化的实验方案。

代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。

基因组学marker验证实验 基因表达 逆转录定量PCR（qRT-PCR）是在样品量少或者非常珍贵的情况研究基因表达的模式。

人类宏基因组学的主要研究方法是利用高通量测序技术对宏基因组进行测序，并通过处理、分析等步骤来获得微生物组和宿主组的相关数据，如微生物分类和数量、微生物代谢产物、代谢组学数据等，以及宿主基因组的变异和表达等信息。

2、代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?

“代谢组学”是一种整体性的研究策略，其研究策略有点类似于通过分析发动机的尾气成分，来研究发动机的运行规律和故障诊断等的“反向工程学”的技术思路。

概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

代谢组学研究可分为两类：“发现代谢组学”（也称“非靶向代谢组学”）和“靶向代谢组学”。

代谢组学是研究生物体内所有代谢物的科学，它在植物研究中有着广泛的应用。

代谢组学的研究方法：代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品（如尿液、血液、组织、细胞和培养液等）采集后进行生物反应灭活、预处理。

3、简述代谢组学的概念、研究技术和应用

代谢组学 ：利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。代谢组学应用：PS：TIC是在GC-MS或LC-MS等方法中使用的一种色谱图。

概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

植物营养研究：代谢组学可以用于研究植物对不同营养元素的吸收和利用，为合理施肥提供科学依据。植物药用价值研究：通过分析植物中的代谢物，可以评估其药用价值，为中药开发提供参考。

代谢组学隶属于组学范畴之内，目前关注度颇高，它是了解小分子代谢物质（相对分子质量小于1000）数量、种类、丰度的研究技术，可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析，并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

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