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代谢组学的分类(代谢组学kegg)

代谢组学的分类(代谢组学kegg)

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  1. 代谢组学的介绍
  2. 【代谢组学】3.数据分析
  3. 【代谢组学】现代仪器分析技术—代谢组学技术基础及原理
  4. 代谢组学的学科归类

1、代谢组学的介绍

代谢组 :一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。代谢组学 :利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。

代谢组学(metabonomics/metabolomics)是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。

代谢组学是对一系列相似的生物样本中的代谢物进行比较分析的学科。代谢物在生物系统中起着至关重要的作用,因此代谢组学可用于发现和鉴定生物标志物,或更好地了解药物或疾病对已知和未知生物通路的影响。

代谢组学分析一般要求数据为正态分布或者高斯分布,数据通常需要进行Log转化。Log转化可以矫正数据集的异方差性,减少或消除数据结构的不对称性,提高数据结构的正态分布性。

代谢物统计学差异分析及生物信息学分析 本部分分析内容与常规代谢组学一致,主要针对代谢物含量开展单维与多维统计学分析、KEGG通路分析、表达量相关性分析、聚类热图、代谢物分类等分析。

2、【代谢组学】3.数据分析

代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本 。

这里我们采用基于秩的检验方法,其中基因集富集分析(GSEA)是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子,它也可以应用于代谢组数据。

在中心法则的指导下,基因组、转录组、蛋白组通常以 信息流 的方式呈现,而代谢组被认为是新陈代谢的结果。

本部分分析内容与常规代谢组学一致,主要针对代谢物含量开展单维与多维统计学分析、KEGG通路分析、表达量相关性分析、聚类热图、代谢物分类等分析。

代谢组学分析如下:代谢组学研究可分为两类:“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。

3、【代谢组学】现代仪器分析技术—代谢组学技术基础及原理

代谢组学隶属于组学范畴之内,目前关注度颇高,它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术,可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析,并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

代谢组学分析如下:代谢组学研究可分为两类:“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。

代谢组学在茶叶研究中的应用主要有品质鉴定、生理生化过程、功能性成分分析。品质鉴定 通过分析茶叶中代谢产物的种类和含量,鉴定茶叶的品质、产地、品种。不同地区的茶叶具有的独特的香气和口感,与代谢产物的组成密切相关。

4、代谢组学的学科归类

代谢组学是上世纪九十年代中期发展起来的一门新兴学科,是系统生物学的重要组成部分。它是关于生物体系内源代谢物质种类、数量及其变化规律的科学,研究生物整体、系统或器官的内源性代谢物质及其所受内在或外在因素的影响。

代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。

代谢组学是研究生物体内代谢产物的种类、分布和变化规律的学科。生物信息学在代谢组学中的应用主要包括代谢物鉴定、通路分析和代谢物组学等方面。

代谢组学是研究生物体内所有代谢物的科学,它在植物研究中有着广泛的应用。

基因组学-功能基因;蛋白质组学-差异蛋白;转录组学-RNA量变;代谢组学-次生代谢物。

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