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代谢组学l投稿,代谢组学一般研究方法及步骤

代谢组学l投稿,代谢组学一般研究方法及步骤

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  1. 7.多关联双亲染色体片段代换系(CSSL)群体的代谢组分析
  2. 快看,各组学的实验方案,给文章加料!
  3. CELL | 代谢组学和转录组学的整合分析揭示肝再生过程细胞代谢路径的重构...
  4. 代谢组学细胞样本收集

1、7.多关联双亲染色体片段代换系(CSSL)群体的代谢组分析

本文以三个具有共同轮回遗传背景的染色体片段代换系群体的剑叶为材料,对水稻的代谢多样性进行了分析。

为了剖析荔枝果实成熟的调控网络,文章使用72个种质进行了全基因组关联分析(GWAS),发现一个开花相关基因(LITCHI019307)在荔枝中具差异表达。

最终组装后的基因组大小为994Mb,ContigN50为184 Kb,ScaffoldN50达48 Mb,其中有397条Scaffold组装并锚定到 20条染色体 水平,组装基因组中确定了4991个SNP和874个SSR,并预测出 46430 个蛋白编码基因,重复序列占到整个基因组的59%。

这里有一包含 65 个染色体片段置换系( chromosome segment substitution line , CSSL) 的群体 ,产生这一群体的 2 个亲本分别为粳稻 Asominori(背景或轮回亲本) 和籼稻 IR24 (供体或非轮回亲本)。

2、快看,各组学的实验方案,给文章加料!

应用的文献较少,实验思路见参考文献[12]。 实验 材料 总RNA样品或mRNA样本(RNA容易降解,需要注意保存方法及周期) 灵敏度:qRT-PCRNorthern blot,特异性:Nortern blotqRT-PCR(上述已说明实验方案)。

立意要新颖 如果文章主题一般化,不新颖,大家都雷同,就难以写出好文章,所以立意要新颖。好文章的立意应该是“从意中所有,从语中所无”。

3、CELL | 代谢组学和转录组学的整合分析揭示肝再生过程细胞代谢路径的重构...

通过分析正常组织与HGSC的蛋白基因组及磷酸蛋白组,揭示了不同同源重组修复(HRD)状态背景下HGSC和正常组织差异的通路。并验证了前期研究中HGSC的关键特征,如存活相关特征、组蛋白乙酰化作为HRD的marker等。

Many cells in multicellular organisms, including animal muscle and nerve cells, either slow the cycle or break out of it altogether.在细胞生长过程中,细胞循环遵循特定程序,分裂准备,分裂成2个子细胞,子细胞再循环。

摘要:加拿大特里福克斯实验室一团队,揭示单细胞转录组学揭示了肝实质和非实质细胞谱系的早期出现。早期肝脏的细胞复杂性和规模限制了对其器官形成过程中出现的分析。

《CellReports》。Cell四大子刊分别是《Cell》《CellMetabolism》《CellHostMicrobe》和《CellReports》。这四本期刊的主题和内容各有侧重。《Cell》主要关注生命科学领域的重大发现和原创性研究。

4、代谢组学细胞样本收集

代谢组学方法已广泛用于动物和植物组织、酵母和细菌,针对不同的组织和细胞类型开发了不同的样品收集技术。

离心:将血液样本在4°C下进行离心(例如,3000 g,10分钟),以分离血浆或血清。血浆:抽血后,立即在4°C下离心(例如,3000 g,10分钟)以分离血浆。血浆位于管子顶部,应小心转移以避免扰动红细胞。

代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

收集细胞没收集完全细胞会导致细胞破碎从而影响代谢组学分析过程。细胞不同于其他的样本,它的代谢物丰富但含量较低且不易收集或收集不完全,因此需要一种有效可靠的处理方法来获得更为全面的代谢物信息。

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