代谢通路与代谢组学-代谢通路图绘制
大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于代谢通路与代谢组学的问题,于是小编就整理了4个相关介绍代谢通路与代谢组学的解答,让我们一起看看吧。
1、如何找到新的细胞通路
在你将配体作用于细胞后,如果你对这个通路一无所知的话,你可以首先做一个蛋白质组的研究,检测一下阳性组和对照组之间蛋白表达的差异,蛋白磷酸化的差异等等,找出差异之后,在单个验证,利用敲出等技术。
rnaseq这么找通路:KEGG:KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes(KEGG)是一种面向整个基因组的路径数据库,包括有关代谢和细胞过程的通路。
首先打开KEGG数据库,你会进入下面这个界面,点击KEGGPATHWAY。红框标识的是PATHWAY的一级分类,蓝框框住的是二级分类。比如第一个Metabolismpathway的二级pathway已经列出来了。
b.PIP2信号通路:胞外signal 膜受体→PIP2IP3 DAG,IP3→内源钙→细胞溶质,胞内Ca2 浓度升高→启动Ca2 信号系统,DAGCM上活化蛋白激酶PKC→DG/PKC信号传递passwa。
2、血红素代谢通路详细资料大全
睾酮在体内转变而产生的5β还原物可诱导ALA合成酶,故有促进血红素生成的作用;一些致癌剂、杀虫药也可诱导肝中ALA合成酶而促进血红素生成,这有利于产生细胞色素P450等,增强肝组织对药物或毒物的生物转化作用。
血红素在血红素加氧酶的作用下生成胆绿素、CO和二价铁离子,胆绿素随即在胆绿素还原酶的作用下生成胆红素,而二价铁离子也转变成铁蛋白。
成熟红细胞保留的代谢通路主要是葡萄糖的酵解和磷酸戊糖通路以及3一二磷酸甘油酸支路。
戊糖磷酸途径是一个葡萄糖-6-磷酸经代谢产生NADPH和核糖-5-磷酸的途径。该途径包括氧化和非氧化两个阶段,在氧化阶段,葡萄糖-6-磷酸转化为核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成两分子的NADPH。
成熟红细胞除质膜和胞质外,无其他细胞器(如线粒体)。因此成熟红细胞利用葡萄糖有三条代谢途径:糖酵解途径、2,3-BPG(2,3-二磷酸甘油酸)旁路和磷酸戊糖途径。
3、紧急求助,代谢组学的代谢通路富集分析和MYROLE该怎么用
对于非靶向代谢组学研究,需要提取细胞和体液中的多种代谢物,并去除无需分析的蛋白质等成分。再加上代谢物的理化性质多样,丰度动辄相差若干数量级,更进一步增加了提取的难度。液液萃取这种两相分离方法常被用于代谢物的提取。
对于非靶向代谢组学研究,需要提取细胞和体液中的多种代谢物,并去除无需分析的蛋白质等成分。再加上代谢物的理化性质多样,丰度动辄相差若干数量级,更进一步增加了提取的难度。液液萃取这种两相分离方法常被用于代谢物的提取。
代谢组学的代谢通路富集分析和MYROLE该怎么用 代谢组学是对一系列相似的生物样本中的代谢物进行比较分析的学科。
液液萃取这种两相分离方法常被用于代谢物的提取,更进一步增加了提取的难度,需要提取细胞和体液中的多种代谢物,丰度动辄相差若干数量级。
4、如何利用代谢组学结果画代谢通路
蛋白质组学:通过研究蛋白质的表达、相互作用和修饰,可以识别出新的蛋白质通路和信号转导过程。代谢组学:研究细胞的代谢物和代谢过程,可以发现新的代谢通路。
结果表明,调整水相/有机相的比例对于两相分离非常重要。同时水相pH 值对提取的代谢物数量也有很大影响,为了提取尽可能多的代谢物,需要采用多个pH 值进行提取。
在中心法则的指导下,基因组、转录组、蛋白组通常以 信息流 的方式呈现,而代谢组被认为是新陈代谢的结果。
代谢物提取,一般要求每组至少10个样;在所有提取好的样本中取等量混合作为QC;QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本。
代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。
到此,以上就是小编对于代谢通路与代谢组学的问题就介绍到这了,希望介绍关于代谢通路与代谢组学的4点解答对大家有用。
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