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脂质代谢组学与感染(脂质代谢重点总结)

脂质代谢组学与感染(脂质代谢重点总结)

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  1. 为什么糖组学和脂质组学的研究没有被人们足够的重视
  2. 代谢组学细胞样本收集
  3. 【代谢组学】1.代谢组学简介
  4. 浅析:NASH和NAFLD的代谢组学研究
  5. 德国科学家找到9个干扰脂代谢的基因变异

1、为什么糖组学和脂质组学的研究没有被人们足够的重视

该杂志接收以下领域的original article、protocol和review:转录组学,基因组学,蛋白质组学,代谢组学,糖组学,脂质组学,相互作用学,通量组学,生物组学等以及所有细胞相关的研究。

另一方面,糖组学和表观基因组学仅在多组学环境中出现过一次(连同mRNA和代谢组学),相关研究使用RF的图形变体研究与年龄相关的合并症。最近,代谢组学和蛋白质组学也与脂质组学相结合,使用PLS-DA和Extra Trees来评估COVID-19患者。

2、代谢组学细胞样本收集

代谢组学方法已广泛用于动物和植物组织、酵母和细菌,针对不同的组织和细胞类型开发了不同的样品收集技术。

离心:将血液样本在4°C下进行离心(例如,3000 g,10分钟),以分离血浆或血清。血浆:抽血后,立即在4°C下离心(例如,3000 g,10分钟)以分离血浆。血浆位于管子顶部,应小心转移以避免扰动红细胞。

代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

收集细胞没收集完全细胞会导致细胞破碎从而影响代谢组学分析过程。细胞不同于其他的样本,它的代谢物丰富但含量较低且不易收集或收集不完全,因此需要一种有效可靠的处理方法来获得更为全面的代谢物信息。

即 重要程度 ; 一般我们使用第第二主成分的VIP来表示这个m/z对模型分型的贡献程度, VIP=1被认为是具有显著贡献的 。

3、【代谢组学】1.代谢组学简介

代谢组 :一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。代谢组学 :利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。

概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。

代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。

代谢组学隶属于组学范畴之内,目前关注度颇高,它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术,可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析,并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分。

4、浅析:NASH和NAFLD的代谢组学研究

Gilead 的NASH / NAFLD动物研究模型中代谢组学的应用 Gilead通过代谢组学为临床前研究在NASH研究中的应用提供了一个很好的例子。

NAFLD可以发展为更危险非酒精性脂肪性肝炎(NASH),这表明炎症和肝细胞损伤以及肝脏中的脂肪都存在。到2030年,美国的NASH病例数也有望攀升至预计的2700万。

NAFLD的致病机制受到多种代谢,遗传和微生物组相关因素的影响。比如遗传差异可影响约20%-70%的疾病风险,PNPLA3基因是与NAFLD易感性相关的最明确遗传变异。这些遗传变异也可能还会影响NAFLD的疾病,如冠状动脉疾病、肥胖。

如果没有有效的治疗,NAFLD可能发展为非酒精性脂肪性肝炎(NASH),进而可能导致肝细胞癌和一系列代谢紊乱。在过去的几十年里,NASH已经成为美国肝移植需求的主要原因。

5、德国科学家找到9个干扰脂代谢的基因变异

近日,德国科学家发现了9个干扰脂代谢的新的基因变异,这一研究成果将有助于增进人们对糖尿病成因的理解,也有助于糖尿病的早期诊断和治疗新方法的研发。

近日,德国糖尿病研究中心(German Center for Diabetes Research ,DZD)研究人员在人类和小鼠中发现一个新的基因家族,它们产生与免疫相关的调节蛋白可以抵消肝脏中的脂肪累积。

此次研究中,科学家首次发现FTO基因等“肥胖基因”如何影响一个人的胖瘦。德国杜塞尔多夫大学科学家乌尔里希·吕特尔等人的研究也发现,“FTO”基因是一种与肥胖相关的基因,也称“肥胖基因”。

英国科学家希尔因发现肌肉生热、德国科学家迈尔霍夫因研究肌肉中氧的消耗和乳酸代谢而共同取得诺贝尔生理学或医学奖。1923年12月10日第二十三届诺贝尔奖颁发加拿大科学家班廷、英国科学家麦克劳德因发现胰岛素而共同取得诺贝尔生理学或医学奖。

干扰代谢。美国加州大学欧文分校研究人员发现,高脂肪饮食会影响控制身体内部“时钟”的分子机制,诱发代谢紊乱,导致糖尿病、肥胖等代谢性疾病。导致肝病。

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