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1. 代谢组学中FC值是什么意思
2. 代谢组差异代谢物分析简介
3. 【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合

1、代谢组学中FC值是什么意思

fold change就是样本之间代谢物浓度的差异倍数，用KO的浓度除以WT即可。小于1就是浓度降低了，大于1就是升高。经常还会用到log2 fold change，意思是取log2，这样便于分析。

医学fc指的是甲胎蛋白测定值（AFP）和胆碱酯酶（ChE）的指标结果之间比值的计算结果，这个计算结果被称为fc值（function checker）。在肿瘤标志物检测中，医学fc值是非常重要的指标之一。

log2FC 中的FC即 fold change，表示两样品（组）间表达量的比值，对其取以2为底的对数之后即为log2FC。

翻译成中文是差异倍数（fold change），也叫作radio，简单来说就是基因在一组样品中的表达值的均值除以其在另一组样品中的表达值的均值。如果规定FC2为上调，那么FC1/2为下调。

FC是平均载气流速，用来计算死体积和保留体积 死时间：从进样到惰性气体峰出现极大值的时间，以td表示。保留时间：从进样到出现色谱峰最高值所需的时间，以tr表示。保留时间与死时间之差称校正保留时间。

2、代谢组差异代谢物分析简介

代谢物 ：所有分子量小于1500Da的小分子物质，包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺类、醛类化合物、脂质、萜类、类固醇、生物碱、小分子药物等等。代谢组 ：一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。

代谢组学是从整体上研究复杂生命现象的新兴学科。研究代谢组学的关键是要发展大规模、并行化测定复杂混合体系中代谢物组成信息和对大量数据进行分析和建模的能力。技术手段的发展是代谢组学发展的关键因素。

代谢组学（metabonomics/metabolomics）是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

代谢组学隶属于组学范畴之内，目前关注度颇高，它是了解小分子代谢物质（相对分子质量小于1000）数量、种类、丰度的研究技术，可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析，并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

3、【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合

这里我们采用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析（GSEA）是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。

肝脏疾病与肝细胞分裂能力下降密切相关，并且细胞代谢对组织稳态和再生很重要。由于代谢变化是肝脏疾病的标志，因而对代谢和细胞分裂之间的联系进行了研究。

[代谢组学与 16S 的检测主要是物种类别或者丰度与代谢产物丰度的关联。而宏基因组与代谢组学的关联主要是其代谢通路与基因功能和代谢产物的关联。

代谢组学隶属于组学范畴之内，目前关注度颇高，它是了解小分子代谢物质（相对分子质量小于1000）数量、种类、丰度的研究技术，可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析，并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

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