大家好，今天小编关注到一个比较有意思的话题，就是关于代谢组学的模型的问题，于是小编就整理了4个相关介绍代谢组学的模型的解答，让我们一起看看吧。

1. 【代谢组学】3.数据分析
2. 浅析:NASH和NAFLD的代谢组学研究
3. plsda图怎么解释
4. 【代谢组学】4.生物标志物分析

1、【代谢组学】3.数据分析

代谢物提取，一般要求每组至少10个样； 在所有提取好的样本中取等量混合作为QC； QC样本与实验样本穿插上机，开始十个QC，结尾三个QC，中间每十个样本穿插一个QC样本 。

这里我们采用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析（GSEA）是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。

在中心法则的指导下，基因组、转录组、蛋白组通常以 信息流 的方式呈现，而代谢组被认为是新陈代谢的结果。

本部分分析内容与常规代谢组学一致，主要针对代谢物含量开展单维与多维统计学分析、KEGG通路分析、表达量相关性分析、聚类热图、代谢物分类等分析。

代谢组学分析如下：代谢组学研究可分为两类：“发现代谢组学”（也称“非靶向代谢组学”）和“靶向代谢组学”。

2、浅析:NASH和NAFLD的代谢组学研究

Gilead 的NASH / NAFLD动物研究模型中代谢组学的应用 Gilead通过代谢组学为临床前研究在NASH研究中的应用提供了一个很好的例子。

NAFLD可以发展为更危险非酒精性脂肪性肝炎（NASH），这表明炎症和肝细胞损伤以及肝脏中的脂肪都存在。到2030年，美国的NASH病例数也有望攀升至预计的2700万。

NAFLD的致病机制受到多种代谢，遗传和微生物组相关因素的影响。比如遗传差异可影响约20%-70%的疾病风险，PNPLA3基因是与NAFLD易感性相关的最明确遗传变异。这些遗传变异也可能还会影响NAFLD的疾病，如冠状动脉疾病、肥胖。

如果没有有效的治疗，NAFLD可能发展为非酒精性脂肪性肝炎（NASH），进而可能导致肝细胞癌和一系列代谢紊乱。在过去的几十年里，NASH已经成为美国肝移植需求的主要原因。

大脑变慢。研究发现，高脂饮食中游离的饱和脂肪酸会导致血脑屏障中的蛋白转运体数量下降，使海马体和大脑皮层缺乏葡萄糖，出现注意力不集中、反应迟缓等问题。干扰代谢。

3、plsda图怎么解释

Plsda分析是偏最小二乘判别分析的一种变体。它是一种结合了PLS回归和线性判别分析的多元统计方法。它被广泛用于生物信息学等领域，具有高效、高准确性和数据解释性较强等优点。该方法适用于高维数据降维、变量筛选和分类预测。

PLS-DA分析法指的是偏最小二乘回归分析法。

PCA怎么看？2）偏最小二乘法 PLSDA的图和PCA类似。只是一种监督学习的方法，事先给样本分类，最后看能否将不同组分开。用R2和Q2进行模型评价。

下面实验时我用相同数据，采用不同软件得到的PLSDA结果图，可以看到左边图完全分不开，右侧图能够清晰分开，可以看出不同峰检测算法对于信号的检测对比差异非常明显。

采集方法：通常采用静脉抽血，使用无菌采血管，可以选择含有或不含有抗凝剂的管子，视后续处理和分析需求而定。样本量：通常需要1-2 mL血液。

4、【代谢组学】4.生物标志物分析

可以看出，图中最佳的生物标志物组是基于PLS-DA分析VIP值排序的前2个代谢物组成的生物标志物组。验证上述筛选出的生物标志物组，或选择特定的生物标志物组，计算区分效果（AUC）值。

代谢组学的研究方法：代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品（如尿液、血液、组织、细胞和培养液等）采集后进行生物反应灭活、预处理。

基本原理 生物标志物是指发现于地质体中的化学性质稳定、碳骨架结构具有明显生物起源特征的有机化合物。如甾类和萜类化合物烷。

代谢组学 ：利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。代谢组学应用：PS：TIC是在GC-MS或LC-MS等方法中使用的一种色谱图。

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