本篇文章给大家谈谈代谢组学通路验证，以及代谢组学和信号通路对应的知识点，希望对各位有所帮助，不要忘了收藏本站喔。 今天给各位分享代谢组学通路验证的知识，其中也会对代谢组学和信号通路进行解释，如果能碰巧解决你现在面临的问题，别忘了关注本站，现在开始吧！

1. 代谢组学如何结合16S 测序与宏基因组测序
2. 代谢组学分析是干嘛的
3. 如何找到新的细胞通路

1、代谢组学如何结合16S 测序与宏基因组测序

这里我们采用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析（GSEA）是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。

此外，还需要结合基因组学研究获得的数据。Gary Siuzdak博士在美国克利普斯研究院（TSRI）从事生物信息学问题的研究，他设计了一个分析来自不同样品代谢产物变化的实验方案。

代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。

基因组学marker验证实验 基因表达 逆转录定量PCR（qRT-PCR）是在样品量少或者非常珍贵的情况研究基因表达的模式。

2、代谢组学分析是干嘛的

“靶向代谢组学”（targeted metabolome）的目的则是定量验证特定代谢产物的表达差异。

代谢组学隶属于组学范畴之内，目前关注度颇高，它是了解小分子代谢物质（相对分子质量小于1000）数量、种类、丰度的研究技术，可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析，并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

代谢组学是对代谢组学的研究，而代谢组学是对特定生物体对致病性刺激或基因修饰的多参数代谢反应的研究。NMR对于物质结构的指认要比MS更精确（异构体）对定性非常有用，成为非靶向代谢组学的重要方向。

代谢组学是基因组学、转录组学和 蛋白质组学 的下游补充，提供生物系统生理状态的总体评估。它代表了遗传调节的终点及其对细胞中酶活性和内源性生化反应变化的影响。

3、如何找到新的细胞通路

在你将配体作用于细胞后，如果你对这个通路一无所知的话，你可以首先做一个蛋白质组的研究，检测一下阳性组和对照组之间蛋白表达的差异，蛋白磷酸化的差异等等，找出差异之后，在单个验证，利用敲出等技术。

rnaseq这么找通路：KEGG：KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes（KEGG）是一种面向整个基因组的路径数据库，包括有关代谢和细胞过程的通路。

b.PIP2信号通路：胞外signal 膜受体→PIP2IP3 DAG，IP3→内源钙→细胞溶质，胞内Ca2 浓度升高→启动Ca2 信号系统，DAGCM上活化蛋白激酶PKC→DG/PKC信号传递passwa。

首先打开KEGG数据库，你会进入下面这个界面，点击KEGGPATHWAY。红框标识的是PATHWAY的一级分类，蓝框框住的是二级分类。比如第一个Metabolismpathway的二级pathway已经列出来了。

http：/cgap.nci.nih.gov/Pathways/BioCarta_Pathways，在页面的旁边有pathway searcher，大家可以通过它找到自己需要的内容。信号通路是指能将细胞外的分子信号经细胞膜传入细胞内发挥效应的一系列酶促反应通路。

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