大家好，今天小编关注到一个比较有意思的话题，就是关于代谢组学热图用什么软件做的问题，于是小编就整理了3个相关介绍代谢组学热图用什么软件做的解答，让我们一起看看吧。

1. 怎样用prism做热图?
2. R数据可视化5:热图Heatmap
3. 热图如何绘制-complexheatmap绘制热图

1、怎样用prism做热图?

打开GraphPad Prism软件，选择grouped，按下图或数据要求选择，最后点create。输入或粘贴数据。若需添加行题目，可点击下图红圈，或拉着下图黄线标注的竖线向右拖动，即可出现title列。

第四种，密度函数可视化图，用来表示出图中点密度的热图，使人们能够独立在变焦参数感知点的密度。在2015年Perrot等人提出的一种方法，通过使用Spark和Hadoop等大数据基础设备，利用密度函数可看到几十亿个点。

打开GraphPad Prism软件，并打开你的数据文件。选择“Plot”菜单中的“Heat Map”选项。在弹出的窗口中，选择你需要生成热图的行列数和颜色方案。点击“OK”按钮，生成热图。

打开GraphPad Prism 6，选择XY图（XY graphs），折线图图标，因为是原始数据，需要软件帮你计算均值和误差，因此会弹出以下界面。

首先，打开GraphPad Prism，双击创建一个新文件，将弹出以下界面。其次，选择适当的类型。在这里，以分组为例，选择数据类型/重复编号。接着，分组输入数据后，单击“图形”（图中的直角框2）。

2、R数据可视化5:热图Heatmap

heatmap.2函数和我们之前要求的数据类型不太一样，这个函数输入数据要求是个矩阵（matrix）。

热图（Heatmap）：用颜色变化直观的表达数据之间差异的图，是对实验数据进行质制和差异数据的展现，是数据挖掘类文章的标配。

假设我们有如下数据 要绘制简单的热图，可以使用内置的 heatmap 函数 更改颜色，并为列添加列样本的分类颜色条 内置函数提供的样式较少，无法对某些图形属性进行设置。

我们可以比较一下pheatmap和Heatmap的结果 如果数据当中含有缺失值，如果我们不想去掉想要可视化的话，可以通过na_col来指定颜色 通过上图，我们可以使用对热图的四周都可以进行标题注释。 无监督的聚类属于热图的可视化的一个重要组成部分。

每个单一热点有一个Weight，默认设为1，目前暂时没有用到（ArcGIS Flex的热图实现中，Weight用来在地图缩小时累加多个离散点聚合后中心灰度值的大小。）。

3、热图如何绘制-complexheatmap绘制热图

如果要实现聚类树在heatmap上，我们需要利用ggtree函数，分别绘制聚类树与热力图，最后用aplot包进行拼接即可。

要绘制简单的热图，可以使用内置的 heatmap 函数 更改颜色，并为列添加列样本的分类颜色条 内置函数提供的样式较少，无法对某些图形属性进行设置。

首先放出参考链接：我们在画热图的时候，有时候会遇到想调整热图中单元格子的尺寸的情况。并且希望可以动态的设置，也就是不管是多少数据，格子都可以随着图片大小缩放。

我们可以直接用pheatmap来画，但是区别在于需要将每个基因在细胞中的表达数值显示在热图上，只需要加display_numbers = TRUE参数即可。最后导出pdf图片，用AI修饰一下即可。当然ComplexHeatmap包的Heatmap函数也是适用的。

到此，以上就是小编对于代谢组学热图用什么软件做的问题就介绍到这了，希望介绍关于代谢组学热图用什么软件做的3点解答对大家有用。