代谢组学三大数据库,代谢组学分析平台
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1、转录测序中的nr,nt,swissprot,cog,kegg,go分别是什么意思
基因功能的注释,使用的数据库包括NT/NR, SwissProt/TrEMbl, InterPro, KEGG, COG, Gene ontology等,使用比对的方法,如blast,找出同源相近的基因,并注释功能。
转录本是一个基因序列通过一种剪切后所得的能RNA。以前说转录本都是说表达蛋白的。现在LncRNA的研究多了,也说是一个转录本了。还有没有参考基因组序列的,一般是不可能去GO功能注释的。
go富集分析是什么意思如下:富集分析(Enrichment Analysis) 是一种广泛应用于 生物信息学Q 研究的统计方法,主要用于检验一个基因集合中某些功能或特征的富集程度。
并进行分类。(4) 调控序列和假基因的预测。基因功能的注释,使用的数据库包括NT/NR, SwissProt/TrEMbl, InterPro, KEGG, COG, Gene ontology等,使用比对的方法,如blast,找出同源相近的基因,并注释功能。
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