大家好，今天小编关注到一个比较有意思的话题，就是关于代谢组学如何pca分析的问题，于是小编就整理了5个相关介绍代谢组学如何pca分析的解答，让我们一起看看吧。

1. PCA原理分析
2. 深度空间代谢组学QA(三)| 常规分析内容及数据清洗策略
3. 【代谢组学】3.数据分析
4. 非靶向 | 靶向代谢组学数据分析总结-纲要
5. 如何用origin做pca分析作图

1、PCA原理分析

主成分分析（Pirncipal Component Analysis，PCA）是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法，它可以从多元事物中解析出主要影响因素，揭示事物的本质，简化复杂的问题。

PCA（Principal Component Analysis）是一种常用的数据分析方法。PCA通过线性变换将原始数据变换为一组各维度线性无关的表示，可用于提取数据的主要特征分量，常用于高维数据的降维。

维基百科介绍：主成分分析（英语：Principal components analysis，PCA）是一种分析、简化数据集的技术。主成分分析经常用于减少数据集的维数，同时保持数据集中的对方差贡献最大的特征。

主成分分析法性质：通过正交变换将一组可能存在相关性的变量转换为一组线性不相关的变量，转换后的这组变量。因子分析法性质：研究从变量群中提取共性因子的统计技术。

主成分分析目的在于信息浓缩（但不太关注主成分与分析项对应关系），权重计算，以及综合得分计算。如希望进行排名比较，计算综合竞争力，可使用主成分分析。

2、深度空间代谢组学QA(三)| 常规分析内容及数据清洗策略

空间聚类分析（Segmentation）空间聚类分析的本质是一张空间聚类分析的热图，通过聚类算法后，对有相似代谢模式的区域使用同一种颜色标注，清晰直观的从分子层面对切片进行区域分型。

代谢组学（metabonomics/metabolomics）是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

公司介绍：苏州帕诺米克（BioNovoGene）最早是做基因检测服务的，2017左右聚焦做代谢组学，改名为诺米代谢（PanoMIX），公司2021年获得元生创投亿级融资。

基因编辑：基因编辑技术，特别是CRISPR-Cas9技术，已成为生命科学领域的一个重要工具。它可以准确地更改基因序列，对于治疗遗传性疾病、创新农业生产和研究动植物等领域都具有巨大的潜力。

3、【代谢组学】3.数据分析

代谢物提取，一般要求每组至少10个样； 在所有提取好的样本中取等量混合作为QC； QC样本与实验样本穿插上机，开始十个QC，结尾三个QC，中间每十个样本穿插一个QC样本 。

这里我们采用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析（GSEA）是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。

在中心法则的指导下，基因组、转录组、蛋白组通常以 信息流 的方式呈现，而代谢组被认为是新陈代谢的结果。

本部分分析内容与常规代谢组学一致，主要针对代谢物含量开展单维与多维统计学分析、KEGG通路分析、表达量相关性分析、聚类热图、代谢物分类等分析。

代谢组学分析如下：代谢组学研究可分为两类：“发现代谢组学”（也称“非靶向代谢组学”）和“靶向代谢组学”。

4、非靶向 | 靶向代谢组学数据分析总结-纲要

代谢组学分析如下：代谢组学研究可分为两类：“发现代谢组学”（也称“非靶向代谢组学”）和“靶向代谢组学”。

靶向代谢组学新技术，区别于传统的非定向代谢组学，具有如下优势：样品种类多：生物流体（血液、尿、唾液、肠道微生物）、环境样品、细胞、动植物组织、污水、药品、食品。

拟靶向代谢组学主要包括三个步骤：（1）基于四极杆飞行时间质谱的非靶向分析；（2）母离子/产物离子对的选择及检测参数优化；（3）使用三重四极杆或QTRAP质谱采用MRM模式（包括上述离子对）对样品进行分析。

新污染物的鉴别是一个复杂的过程，非靶向识别流程是其常用的方法之一。下面是新污染物非靶向识别流程的第一步：采集样品：从可能存在新污染物的环境中采集样品，如水体、土壤、空气等。

5、如何用origin做pca分析作图

数据导入。点击右下角pca插件，启动对话框。设置分析数据并点击“OK，进行分析。按照图示点击分析后的图，放大该图。美化图片。图片美化包括颜色、图例、字体大小等等。美化后的图片如图。

出现弹框，选择网格，并且选择垂直，并勾选Y=0选项，当然如果想在Y=1做辅助线，只需要填入，Y=1，点击应用，便出现了Y=0的线条。同理选择网格，并且选择水平，并勾选X=0选项，点击应用，便出现了十字线的辅助线。

打开Origin软件和做好的图。在左边的工具栏找到图形按钮，鼠标单击长按，在弹出的菜单中选择Circletool，圆形图案按钮。按住Ctrl键，鼠标光标在图上单击，不要松开，然后拖动鼠标。就会看到圆形图案的轮廓了。

首先打开 origin，可以看到一个类似Excel的表，第一行是坐标轴的标题名称，第二个是单位，下面的是数据输入的位置。 如图输入数据 然后点击【plot】，有三个图形样式，选择需要的图形，或者在页面下方有快速按钮。

到此，以上就是小编对于代谢组学如何pca分析的问题就介绍到这了，希望介绍关于代谢组学如何pca分析的5点解答对大家有用。