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代谢组学与转录组结合-代谢组学和转录组学

代谢组学与转录组结合-代谢组学和转录组学

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  1. 【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合

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这里我们采用基于秩的检验方法,其中基因集富集分析(GSEA)是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子,它也可以应用于代谢组数据。

作为系统生物学不可或缺的部分,代谢组学的特点在于其研究对象——小至分子量1500的化合物,这些微观世界的信息恰好能够揭示个体健康状况的独特特征。

数据采集是探索代谢组学世界的关键,质谱技术(如GC/LC-MS)和核磁共振(NMR)如同精密的显微镜,质谱因其高分辨率而备受青睐,尽管成本相对较高;而NMR则以其无损伤性,为我们揭示代谢物的内在结构。

代谢组学创始人、英国帝国理工大学Jeremy Nicholson教授认为人体应该作为一个完整的系统来研究,应用代谢组学来理解疾病过程,与中医的整体观和辨“证”论治思维方式不谋而合。

代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

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