代谢组学数据研究方法,代谢组学常用分析方法
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1、代谢组学的研究方法和研究流程
先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。
代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。
一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰,最终了解不同化合物的结构,建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。
动物方面如果是动态取血,一般采用大鼠眼眶内眦静脉丛取血。如果是一次性取血,大鼠采用腹主动脉取血,小鼠可以采用心脏取血或者腹主动脉取血。理论来说,血清做代谢组学效果会更好,血清中代谢物的含量略高于血浆。腹主动脉取出的血较多,因此血清或血浆样品均可以作为代谢组学样品进行分析。
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