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代谢组学检测血浆样本-代谢组学血清样品

代谢组学检测血浆样本-代谢组学血清样品

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  1. 做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理

1、做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理

基于超高效液相色谱-质谱联用技术的非靶向代谢组学分析流程一般包括: 样品的收集和预处理、代谢物提取、LC-MS全扫描检测、数据预处理、统计分析及差异物结构鉴定。 其中第一步,样品的收集和重复设置尤为重要,直接关系到实验结果以及数据分析。

代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本 。得到质谱谱图数据经软件处理后得到峰表。

代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

根据样本或分组内缺失值的比例,进行数据过滤是代谢组学分析中常用的方法。缺失值填充 对于未被过滤的缺失值,如果直接忽视,这样的数据矩阵可能会影响后续算法的计算,将会触发异常。

例如,在匹配样本设计中,单个血液样本可以分成两份,其中一份在代谢平台上分析,另一份在转录平台上分析。然而,匹配样本设计可以基于同一生物样本小份体液,但也可以不一定要基于,例如在同一时间点从同一个人采集的血液样本和另一组织活检样本,即匹配。 预处理。

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