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1. 热图如何绘制-complexheatmap绘制热图

1、热图如何绘制-complexheatmap绘制热图

如果要实现聚类树在heatmap上，我们需要利用ggtree函数，分别绘制聚类树与热力图，最后用aplot包进行拼接即可。由于ComplexHeatmap包绘制的热力图是一个Heatmap对象，故他与其他图形不同，自身可以与其他Heatmap对象结合，我们只需要利用 号或者%v%连接符对多个Heatmap对象进行水平或垂直连接就可以了。

首先放出参考链接：我们在画热图的时候，有时候会遇到想调整热图中单元格子的尺寸的情况。并且希望可以动态的设置，也就是不管是多少数据，格子都可以随着图片大小缩放。

分组行名还是需要手动调整。三角热图 总是在某些文章中（可能高分文章作图比较有性格吧）出现不一样的热图，除了上述讲的环状，还有三角热图，可以理解为热图只显示斜对角一半。 利用ComplexHeatmap正常加载数据处理，画热图加一个函数和改变参数就可以实现。

热图出来了，但有点不对劲，横轴重叠一起了。一个办法是调整图像的宽度，另一个是旋转横轴标记。设置想要的颜色。调整legend的位置。调整背景和背景格线以及X轴、Y轴的标题。合并以上命令，就得到了下面这个看似复杂的绘图命令。图形出来了，就得考虑存储了，至此，完成了简单的heatmap的绘图。

热图（Heatmap）：用颜色变化直观的表达数据之间差异的图，是对实验数据进行质制和差异数据的展现，是数据挖掘类文章的标配。例如上图，每个小方格表示每个基因，其颜色表示该基因表达量大小，表达量越大颜色越深（红色为上调，蓝色为下调）。

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