差异代谢组学fc值和vip值-差异代谢物
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1、代谢组学中FC值是什么意思
fold change就是样本之间代谢物浓度的差异倍数,用KO的浓度除以WT即可。小于1就是浓度降低了,大于1就是升高。经常还会用到log2 fold change,意思是取log2,这样便于分析。
可以使用Excel从结果中复制出物质及对应的定量结果从而得到FC值。fc值的计算方式:A物质在对照组中的定量结果为1,在处理组中定量结果为3,那么此物质的FC值即为3。fc定义:根据代谢物的相对定量或绝对定量结果,计算某个代谢物在两组间表达量的差异倍数(FoldChange),简称FC值。
医学fc指的是甲胎蛋白测定值(AFP)和胆碱酯酶(ChE)的指标结果之间比值的计算结果,这个计算结果被称为fc值(function checker)。在肿瘤标志物检测中,医学fc值是非常重要的指标之一。例如,肝癌病人常常有高水平的AFP,但假如没有ChE数据中来参照,可能就会导致诊断的不准确。
当fc值等于1时,说明两个样本之间的基因表达量没有明显差异,如果fc值大于1,则说明某个基因在实验组中的表达量较高;如果fc值小于1,则说明某个基因在实验组中的表达量较低,fc值越大,表示差异越明显,而fc值越小则表示差异越微弱。
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