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代谢组学按研究对象-代谢组学研究主要内容

代谢组学按研究对象-代谢组学研究主要内容

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  1. 代谢组学的介绍
  2. 非模式生物可以进行代谢组学分析吗
  3. 代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?

1、代谢组学的介绍

代谢组 :一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。代谢组学 :利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。

代谢组学(metabonomics/metabolomics)是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。

代谢组学是对一系列相似的生物样本中的代谢物进行比较分析的学科。代谢物在生物系统中起着至关重要的作用,因此代谢组学可用于发现和鉴定生物标志物,或更好地了解药物或疾病对已知和未知生物通路的影响。

代谢组学分析一般要求数据为正态分布或者高斯分布,数据通常需要进行Log转化。Log转化可以矫正数据集的异方差性,减少或消除数据结构的不对称性,提高数据结构的正态分布性。

代谢物统计学差异分析及生物信息学分析 本部分分析内容与常规代谢组学一致,主要针对代谢物含量开展单维与多维统计学分析、KEGG通路分析、表达量相关性分析、聚类热图、代谢物分类等分析。

2、非模式生物可以进行代谢组学分析吗

KEGG指的是京都基因与基因组百科全书,通常我们使用KEGG中的pathway模块,将基因映射到某些通路上,了解基因参与生物体中的代谢过程等。

代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。

植物生理和分子生物学研究:代谢组学可以揭示植物的生理状态和基因表达模式,从而帮助理解植物的生长、发育和响应环境压力的机制。

近年来,随着高通量测序技术的发展,我们可以快速且准确地测序整个基因组或特定区域的DNA序列,产生大量的数据。通过生物信息学方法对这些数据进行处理和分析,我们可以更好地理解基因组的结构和功能。

代谢组学(metabonomics/metabolomics)是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。

3、代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?

“代谢组学”是一种整体性的研究策略,其研究策略有点类似于通过分析发动机的尾气成分,来研究发动机的运行规律和故障诊断等的“反向工程学”的技术思路。

概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。

代谢组学是研究生物体内所有代谢物的科学,它在植物研究中有着广泛的应用。

“靶向代谢组学”的研究对象是确定的一种或几种代谢产物,并用大量的试验样本进行验证,由于要进行定量研究,有可能会使用内标来制定标准曲线(绝对定量)。

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