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代谢组学中看组间靠近-代谢组学可以检测哪些样品

代谢组学中看组间靠近-代谢组学可以检测哪些样品

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  1. 代谢组学概述

1、代谢组学概述

代谢组学,一个源自基因组学与蛋白质组学理念的领域,主要致力于对生物体内所有小分子代谢物(相对分子质量通常小于1000)进行定量分析。这一研究方法的核心目标是揭示代谢物与生物体生理病理状态之间的复杂关联,从而深化我们对生物系统动态的理解,它是系统生物学研究的重要组成部分。

代谢组学隶属于组学范畴之内,目前关注度颇高,它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术,可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析,并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。然而,代谢组学涉及到的技术原理相对比较广泛,运用的技术手段不同,原理也略有不同。

它通过精密的逐点扫描,将样品中分子的分布转化为高分辨率地图,揭示出前所未有的信息密度和深度。

代谢组分析的代谢产物,是大分子和小分子的混合物,主要也是用液相和质谱。总而言之,这些技术都想从全局找变量,都是一种top-down的研究方法,原因很简单:避免‘只缘身在此山中’的尴尬。

进行代谢途径分析的两个最常见的框架是基于过度代表(OR)(或)或基于秩的假设检验。 这里我们采用基于秩的检验方法,其中基因集富集分析(GSEA)是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子,它也可以应用于代谢组数据。

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