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代谢组学研究样本处理-代谢组学验证实验

代谢组学研究样本处理-代谢组学验证实验

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  1. 做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理

1、做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理

采集方法:通常采用静脉抽血,使用无菌采血管,可以选择含有或不含有抗凝剂的管子,视后续处理和分析需求而定。样本量:通常需要1-2 mL血液。血液样本处理:离心:将血液样本在4°C下进行离心(例如,3000 g,10分钟),以分离血浆或血清。

基于超高效液相色谱-质谱联用技术的非靶向代谢组学分析流程一般包括: 样品的收集和预处理、代谢物提取、LC-MS全扫描检测、数据预处理、统计分析及差异物结构鉴定。 其中第一步,样品的收集和重复设置尤为重要,直接关系到实验结果以及数据分析。

数据预处理:峰匹配和归一化:对以上结构鉴定得到的数据进行预处理,包括峰匹配、归一化处理,确保数据质量适合进行PCA分析。主成分分析(PCA):数据导入:将处理后的代谢物数据导入统计软件或专用的生物信息学工具。

例如,在匹配样本设计中,单个血液样本可以分成两份,其中一份在代谢平台上分析,另一份在转录平台上分析。然而,匹配样本设计可以基于同一生物样本小份体液,但也可以不一定要基于,例如在同一时间点从同一个人采集的血液样本和另一组织活检样本,即匹配。 预处理。

百趣生物 成立时间:2012(最早是阿趣生物)地点:上海 市场份额:14 公司人数:约300人 公司介绍:国内最早专门从事代谢组学科研服务的公司之一,主打非靶标代谢组学检测分析服务,其优势是数据质量,据说能做到美国metabolon的水平,CV10%。

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