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  1. 【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合

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这里我们采用基于秩的检验方法,其中基因集富集分析(GSEA)是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子,它也可以应用于代谢组数据。使用GSEA或OR分析的途径分析也可以通过结合代谢组学和转录组学数据来进行,好处是从这两种数据类型中收集信息以确定代谢途径富集程度。

代谢组学,一个源自基因组学与蛋白质组学理念的领域,主要致力于对生物体内所有小分子代谢物(相对分子质量通常小于1000)进行定量分析。这一研究方法的核心目标是揭示代谢物与生物体生理病理状态之间的复杂关联,从而深化我们对生物系统动态的理解,它是系统生物学研究的重要组成部分。

单细胞代谢组学技术更是日新月异,微室技术、SERS微液滴、PDMS芯片等创新手段,使得我们能够窥探单个细胞的微观代谢世界,从scMetabolism到原位微探针,每一项技术都为理解生命提供了新的窗口。总的来说,代谢组学是一场对生命深处秘密的探索,每一次数据的解读,都是对生命现象的更深层次理解。

首先,目前肠道微生物联系最紧密的三种代谢产物是氨基酸、短链脂肪酸或胆汁酸,以这三种代谢产物做靶向检测与微生物组学做关联分析也占绝大多数。否则,便需利用代谢组广筛方法,得到差异较大或者丰度高的代谢产物后决定下一步研究的方向。

代谢组学”可能成为我国传统医学走向国际化的通用语言。上海系统生物医学研究中心与上海中医药大学合作,在用代谢组学研究中医肾阳虚证的分子机理、中药肾毒性的预测以及支持中药在国际市场的登记注册等方面已经取得很好成效,显示了代谢组学与中国传统中医药结合的强大生命力。

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