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代谢组学数据处理的重要性(代谢组学数据挖掘)

代谢组学数据处理的重要性(代谢组学数据挖掘)

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  1. 代谢组学 表达量数据预处理 简介

1、代谢组学 表达量数据预处理 简介

数据归一化是将数据映射到特定范围之内再进行处理,有利于便捷快速的运算。数据归一化是数据预处理重要一步,可消除样本处理、浓度差异、仪器偏差等统误差。代谢组学常用数据归一化方法:中位数、平均数、总和、指定样本和内参。

预处理。分析中使用的数据集需要适用于特定分子分析平台的标准方法先行进行预处理,包括质量控制和排除潜在异常值和/或非典型观测。 数据分析的方法 1 mQTL分析:代谢特性的遗传驱动因素 描述遗传变异(通常以单核苷酸多态性(SNPs)的形式)与代谢产物丰度之间的统计关联,为理解代谢的遗传驱动因素提供了手段。

一般有如下几点: 数据预处理。如缺失值过滤填充、数据归一化等。 数据质控。包括CV分布、QC等。 统计分析。包括单变量、多变量等。 功能分析。包括Pathway、网络分析、Biomarker筛选等。

代谢组学的研究方法:代谢组学研究一般包括代谢组数据的采集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)采集后进行生物反应灭活、预处理。

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