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蛋白质组学有哪些数据库,蛋白质组学技术应用

蛋白质组学有哪些数据库,蛋白质组学技术应用

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  1. 国际著名的三大蛋白质数据库

1、国际著名的三大蛋白质数据库

国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。

PDB蛋白质数据库 PDB(Protein Data Bank)是全世界最大的蛋白质结构数据库。它包含了大量的蛋白质三维结构信息,这些结构信息是基于X射线晶体学和核磁共振等实验手段得到的。科研人员可以通过该数据库查询蛋白质的结构、功能以及其他相关信息。

PIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库,可在这里下载。这是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库,其中包括来自几十个完整基因组的蛋白质序列。

常用的蛋白质数据库有很多,其中Uniprot被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。Uniprot下包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD,详见Uniprot_百度百科。其他的蛋白数据库有PDB(Protein Data Bank,简称PDB,开始建立于1971年)等。

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