蛋白质组学平台推荐(蛋白质组学国家重点实验室)
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1、已知蛋白序列怎么查找基因名称
回答如下:要查找蛋白序列对应的基因名称,可以采用以下几种方法:
1. 基于基因数据库的搜索:将蛋白序列输入基因数据库,如NCBI、Ensembl等,通过基因名称或蛋白序列相似性进行搜索,找到与该蛋白序列相对应的基因名称。
2. BLAST搜索:使用BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)软件,将蛋白序列与基因数据库中的序列进行比对,找到最相似的序列,并从中获取基因名称。
3. 使用GeneCards等基因信息平台:GeneCards是一个集成了各种基因信息的平台,可以通过输入蛋白序列,查找对应的基因名称和其他相关信息。
4. 基于同源序列的搜索:将蛋白序列输入同源序列搜索工具,如HMMER、Phyre2等,通过比对蛋白序列与已知的同源序列,找到对应的基因名称。
1、首先你写出正确的英文蛋白质名:insulin,hemoglobin
2、到hgnc网站: 输入以上单词进行查询
3、查询结果:inslin:的基因名字ins hemoglobin有很多对应,因为hemoglobin是有很多亚基的,比如你要研究alpha 1亚基,那基因名字就是hba1喽
就这么简单了。
如果你想批量查询就去吧hgnc数据库下来,就ok了。
网址中输入NCBI,点开NCBI主页。在主页的右上方有可选框,选择protein,后面输入蛋白名称,如果想具体找到的话,直接输入物种加蛋白,回车即可。
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