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蛋白质代谢组学笔记,蛋白质组学和代谢组学途径的生物标志物发现

蛋白质代谢组学笔记,蛋白质组学和代谢组学途径的生物标志物发现

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  1. 2019-11-12 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(上)
  2. 蛋白质组学数据分析笔记说明
  3. 临床执业医师生物化学笔记—第一篇第一章氨基酸和蛋白质

1、2019-11-12 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(上)

这次课程的授课老师完全可以用青年才俊四个字来形容:她于2014年博士毕业于德国慕尼黑工业大学(Technische Universitt München)生物分析与蛋白质组学研究所,师从领域的大牛Prof. Bernhard Kuster。

对于蛋白质组学研究来讲,我们对质谱仪器性能的最低要求是:分辨率至少在40,000-50,000,质量准确性应该优于5ppm,质量扫描范围应该在100-3,000,扫描速度是每秒至少获得一张高分辨的一级谱图和十张高分辨的二级谱图。

2、蛋白质组学数据分析笔记说明

建立了基于QE,Fusion的DIA数据采集以及数据分析流程,实现了7500个蛋白的DIA定量分析。

大伙儿都知道,蛋白质组学(proteomics),是研究一种细胞或者一种生物体所表达的全部蛋白质。

将蛋白质组数据与其他组学数据(如转录组或代谢组数据)进行整合,从多层面理解差异蛋白的生物学含义。 生物标志物筛选 如果研究的目标是寻找疾病的生物标志物,进一步分析差异蛋白的诊断、预测和治疗价值。

分子)的关系。因此蛋白质组学的研究通常是高通量的。

实验设计建议 (1)方案一 —— 蛋白质组学 差异蛋白表达量验证 该思路是目前3~5分期刊中最常见的,也是最基础的一种研究思路。

3、临床执业医师生物化学笔记—第一篇第一章氨基酸和蛋白质

蛋白质的四级结构:对蛋白质分子的三级结构而言,只涉及一条多肽链卷曲而成的蛋白质。

一级结构的主要化学键是肽键。维系蛋白质二级结构的因素是氢键 并不是所有的蛋白质都有四级结构。溶液pHpI时蛋白质带负电,溶液pH 蛋白质变性的实质是空间结构的改变,并不涉及一级结构的改变。

氨基酸,多肽和蛋白质的区别为:性质不同、氨基酸的数量不同、用途不同。氨基酸,多肽和蛋白质联系是多肽和蛋白质都是由氨基酸组成,多肽是蛋白质水解的中间产物。

蛋白质是氨基酸通过氨基和羧基脱水缩合而形成肽键连接成链形成的!也就是说,氨基酸是蛋白质的单体。

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