蛋白质组学思考题答案,蛋白质组学绪论
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1、什么是蛋白质组学?
蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
概念 蛋白质组学是阐明生物体各种生物基因组在细胞中表达的全部蛋白质的表达模式及功能模式的学科;包括鉴定蛋白质的表达、存在方式(修饰形式)、结构、功能和相互作用等。
蛋白质组学研究的基本技术 对于蛋白质组学的研究来说,它的最基本的实验手段就是利用双向凝胶电泳(two-dimensional protein electrophoresis, 2DE),在整个 基因组水平上检测蛋白质表达的情况。
蛋白质:是一类生物大分子,由一条或多条肽链组成,每条肽链都由一定数量的氨基酸按一定顺序通过肽键连接而成。
大伙儿都知道,蛋白质组学(proteomics),是研究一种细胞或者一种生物体所表达的全部蛋白质。
2、蛋白质组学名词解释
蛋白质:是一类生物大分子,由一条或多条肽链组成,每条肽链都由一定数量的氨基酸按一定顺序通过肽键连接而成。
蛋白质组学(proteome)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组(genome)两个词的杂合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。
蛋白质的一级结构是指蛋白质分子中从N端至C端的氨基酸排列顺序。蛋白质一级结构的形成与基因编码的氨基酸序列密切相关,是蛋白质结构和功能的基础。
科学家把研究生物体内多糖的科学叫做“糖生物学”,也有人沿袭“基因组学”和“蛋白质组学”的概念把这门学科叫做“糖原组学”。
计算、模拟)。生物信息学的主要研究方向:基因组学 - 蛋白质组学 - 系统生物学 - 比较基因组学,1989年在美国举办生物化学系统论与生物数学的计算机模型国际会议,生物信息学发展到了计算生物学、计算系统生物学的时代。
3、2019-11-12 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(上)
这次课程的授课老师完全可以用青年才俊四个字来形容:她于2014年博士毕业于德国慕尼黑工业大学(Technische Universitt München)生物分析与蛋白质组学研究所,师从领域的大牛Prof. Bernhard Kuster。
对于蛋白质组学研究来讲,我们对质谱仪器性能的最低要求是:分辨率至少在40,000-50,000,质量准确性应该优于5ppm,质量扫描范围应该在100-3,000,扫描速度是每秒至少获得一张高分辨的一级谱图和十张高分辨的二级谱图。
4、蛋白质组学数据分析笔记说明
建立了基于QE,Fusion的DIA数据采集以及数据分析流程,实现了7500个蛋白的DIA定量分析。
大伙儿都知道,蛋白质组学(proteomics),是研究一种细胞或者一种生物体所表达的全部蛋白质。
将蛋白质组数据与其他组学数据(如转录组或代谢组数据)进行整合,从多层面理解差异蛋白的生物学含义。 生物标志物筛选 如果研究的目标是寻找疾病的生物标志物,进一步分析差异蛋白的诊断、预测和治疗价值。
分子)的关系。因此蛋白质组学的研究通常是高通量的。
实验设计建议 (1)方案一 —— 蛋白质组学 差异蛋白表达量验证 该思路是目前3~5分期刊中最常见的,也是最基础的一种研究思路。
5、蛋白组学的研究方法
质谱技术MS:是目前分析蛋白质的主要手段之一。质谱技术可以检测蛋白质的质量、序列、修饰和定量等信息,包括基于母离子扫描MS和tandem MS(MS/MS)等多种方法。
蛋白质组学的研究策略主要包括如下:质谱法:通过测量蛋白质的质量来研究其特性,包括串联质谱技术(MS/MS)用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。
蛋白组学的研究方法如下:蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。
四 定量蛋白质组学方法:⑴ ICAT(isotope-coded affinity tags)方法。ICAT是用于定量蛋白质组学研究的稳定同位素标签法的一种。
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