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蛋白质组学原理PTMs全拼,蛋白质组学综述

蛋白质组学原理PTMs全拼,蛋白质组学综述

大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于蛋白质组学原理PTMs全拼的问题,于是小编就整理了5个相关介绍蛋白质组学原理PTMs全拼的解答,让我们一起看看吧。

  1. 蛋白质磷酸化的定义是什么?
  2. 蛋白质组的技术原理
  3. 如何应用蛋白质组学原理与方法开展生物学基础与应用研究
  4. 国际著名的三大蛋白质数据库
  5. 蛋白质翻译水平检测方法

1、蛋白质磷酸化的定义是什么?

【答案】:是指蛋白质在蛋白激酶的催化下,将ATP分子中磷酸基转移到蛋白质分子中某一个或几个氨基酸残基侧链上,形成磷酸化衍生物的过程。

蛋白质磷酸化[1]:指由蛋白质激酶催化的把ATP或GTP上位的磷酸基转移到底物蛋白质氨基酸残基上的过程,是生物体内一种普通的调节方式,在细胞信号转导的过程中起重要作用。

磷酸化,将磷酸基团加在中间代谢产物上或加在蛋白质(protein)上的过程。其中除去磷酸基团的酶称为磷酸酶。 蛋白质磷酸化可发生在许多种类的氨基酸(蛋白质的主要单位)上,其中以丝氨酸为多,接着是苏氨酸。

磷酸化是指组成蛋白质的氨基酸的羟基被磷酸基团取带,去磷酸化就是磷酸集团在被复原成羟基。

磷酸化是将磷酸基团加在中间代谢产物上或加在蛋白质(protein)上的过程。磷酸基团的添加或除去(去磷酸化)对许多反应起着生物“开/关”作用。

2、蛋白质组的技术原理

蛋白质芯片技术:将具有特定功能的蛋白质固定在芯片上,与样品中的蛋白质发生特异性结合。可以用于高通量筛选蛋白质-蛋白质相互作用、抗体检测等应用。

从广义上来说,蛋白质工程是通过物理、化学、生物和基因重组等技术改造蛋白质或设计合成具有特定功能的新蛋白质。

蛋白质工程的原理,就是指在进行相关操作时遵循的基本原理。

表 面等离子共振技术(Surface Plasmon Resonance,SPR)已成为蛋白质相互作用研究中的新手段。

双向凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。

3、如何应用蛋白质组学原理与方法开展生物学基础与应用研究

通过记录蛋白质的物理相互作用,尽管没有定量调节蛋白质组学的所集中的幅度,这个策略可能对特别通路的具体研究证明高度有效。

质谱法:通过测量蛋白质的质量来研究其特性,包括串联质谱技术(MS/MS)用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。蛋白质互作网络分析:研究蛋白质间的相互作用,揭示蛋白质在细胞内不同通路中的相互作用和功能。

蛋白组学的研究方法如下:蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。

说到靶向蛋白质组学,咱们都知道,一直以来蛋白质组学的应用领域主要是针对基础生物学,比如研究通路、蛋白复合物、互作网络,表征细胞和组织的类型,观察细胞周期内蛋白质的表达等。

4、国际著名的三大蛋白质数据库

国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。

PIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库,可在这里下载。

DDBJ(DNA Data Bank of Japan):DDBJ是日本的国家生物信息学中心,成立于1986年。DDBJ的主要职责是收集、存储、分析和发布日本的生物数据,包括DNA序列、蛋白质序列、基因组数据等。

二级核酸数据库:是通过对一级数据中数据的分析整理归纳注释构建的具有特殊生物学意义和专门用途的数据库。蛋白质数据库一级蛋白质数据库:存储的是通过各种科学手段得到的最直接的基础数据。

DDBJ:DNA Data Base of Japan 是日本人建立的核酸数据库;NCBI中的Genbank是美国建立的核酸数据库;EMBL是欧洲建里的核酸数据库;这三个数据库是连通的,数据共享。

5、蛋白质翻译水平检测方法

蛋白质翻译水平检测方法如下。蛋白质翻译后修饰(post-translationalmodifications,PTMs),如磷酸化、乙酰化、泛素化、SUMO化、糖基化等,大幅度的增加了蛋白质组的复杂性。

双缩脲试剂检测 准备双缩脲试剂和待测样品。将双缩脲试剂A液和B液混合均匀。加入待测样品至双缩脲试剂中,充分混合。观察颜色变化,如果产生紫色反应,则说明样品中含有蛋白质。

免疫印迹法(WB,Western blotting):是常用的蛋白质检测方法,通过特异性抗体与目标蛋白质结合来检测目标蛋白质的表达水平。

蛋白表达水平的检测方法有多种,常用的几种包括:免疫印迹法(WB):通过将蛋白质样品进行电泳分离,然后将其转移到膜上,并利用特异性抗体与目标蛋白结合形成复合物,最后使用化学发光或染色方法检测复合物的存在和相对丰度。

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