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蛋白质组学测序类型有哪些方法(蛋白质测序方法的发展历程)

蛋白质组学测序类型有哪些方法(蛋白质测序方法的发展历程)

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  1. 蛋白质N端测序的测定蛋白质N端序列的方法
  2. 蛋白质组学的研究方法
  3. 蛋白表达水平检测方法有哪几种?
  4. 蛋白组学研究常用的分析技术有哪些?

1、蛋白质N端测序的测定蛋白质N端序列的方法

N-末端测定 A.二硝基氟苯法(FDNB,DNFB):1945年Sanger提出此方法,是他的重要贡献之一。DNP-氨基酸用有机溶剂抽提后,通过层析位置可鉴定它是何种氨基酸。

蛋白质c端测序3种方法:化学法、羧肽酶法、及串联质谱法 其中后两者最近普遍应用的办法。羧肽酶水解法:羧肽酶可以专一性地水解羧基末端氨基酸。根据酶解的专一性不同,可区分为羧肽酶a、b和c。

甲醛滴定法:氨基酸氨基的PKa值较小,羧基的PKa值较大,若用滴定法测定氨基或羧基竭力释放出的H ,均找不到合适的试剂。

丹磺酰氯法:该方法通过多肽或蛋白质的游离末端氨基与丹磺酰氯(DNS-CI)反应,生成DNS-多肽。经过酸水解后,只有N-末端氨基酸会形成强烈的荧光物质DNS-氨基酸,其他游离氨基酸不会产生该荧光物质。

2、蛋白质组学的研究方法

蛋白组学的研究方法如下:蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。

蛋白质组学的研究策略主要包括如下:质谱法:通过测量蛋白质的质量来研究其特性,包括串联质谱技术(MS/MS)用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。

一 双向电泳。双向电泳(two-dimensional electrophoresis, 2-DE)与质谱(mass spectrum, MS)的结合是最常见的蛋白质组学的研究手段。

蛋白质样品的制备:蛋白质样品的制备是蛋白质组学研究的首要环节,也是最为重要的部分。蛋白质样品的质量直接影响到科学研究的真实性和可信度。

胶染色后可以利用凝胶图象分析系统成像,然后通过分析软件对蛋白质点进行定量分析,并且对感兴趣的蛋白质点进行定位。

3、蛋白表达水平检测方法有哪几种?

蛋白表达水平的检测方法有多种,常用的几种包括:免疫印迹法(WB):通过将蛋白质样品进行电泳分离,然后将其转移到膜上,并利用特异性抗体与目标蛋白结合形成复合物,最后使用化学发光或染色方法检测复合物的存在和相对丰度。

有三种,第一是用DNA探针检测,看目的基因是否存在。第二种是用mRNA做探针,看是否有由DNA转录形成的mRNA,原理和前面是一样的,利用碱基互补配对原则。前面两种都是在分子水平检测,第三种是在个体水平直接检测的。

双缩脲试剂检测 准备双缩脲试剂和待测样品。将双缩脲试剂A液和B液混合均匀。加入待测样品至双缩脲试剂中,充分混合。观察颜色变化,如果产生紫色反应,则说明样品中含有蛋白质。

要比较7种细胞中所表达的蛋白质的差异,你可以采用以下方法:二维电泳 (2-DE):使用二维电泳可以将细胞的蛋白质按照等电点和分子量进行分离。不同细胞类型的2-DE图谱会展现出不同的蛋白质斑点模式。

原始样品可为细胞、组织、培养上清、免疫沉淀或亲和纯化的蛋白,以下为定性检测目的蛋白时细胞样品的处理方法,其余的样品制备方法参阅相关文献。 培养细胞或药物处理。 弃培养基,用1X PBS漂洗细胞2次,去尽残留培养基。

4、蛋白组学研究常用的分析技术有哪些?

蛋白质组学的研究方法有蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质功能确定、蛋白质靶向定量技术。蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

酵母双杂交系统、抗体芯片、LCM技术、mic Solution Inc、SPR技术、色谱分离技术、双相电泳技术、有机质谱等等。LCM技术获得的细胞可以用于蛋白质样品的制备。蛋白质样品中的不同类型的蛋白质可以通过二维电泳进行分离。

研究蛋白质间相互作用的主要技术总结如下:酵母双杂交系统酵母双杂交系统是当前广泛用于蛋白质相互作用组学研究的一种重要方法。

蛋白质组学研究的基础技术主要包括以下两个方面:二维电泳 (2-DE):二维电泳是一个用于分离蛋白质的技术,其中第一维度是按照蛋白质的等电点分离,而第二维度是按照蛋白质的分子量分离。

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