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1. 什么是蛋白质组学的基本技术流程
2. 试述如何应用2D-PAGE进行差异蛋白质组学的研究,并分析其优缺点。_百...
3. 蛋白质组学样品前处理的方法

1、什么是蛋白质组学的基本技术流程

蛋白质组学的基本技术流程主要为以下四方面。

蛋白质样品的制备：蛋白质样品的制备是蛋白质组学研究的首要环节，也是最为重要的部分。蛋白质样品的质量直接影响到科学研究的真实性和可信度。

LCM-二维电泳·质道的技术路线是典型的一条蛋白质组学研究的技术路线，除此以外，LCM-抗体芯片也是一条重要的蛋白质组学研究的技术路线。

蛋白质组学研究的基础技术主要包括以下两个方面：二维电泳 （2-DE）：二维电泳是一个用于分离蛋白质的技术，其中第一维度是按照蛋白质的等电点分离，而第二维度是按照蛋白质的分子量分离。

蛋白质组学的研究策略主要包括如下：质谱法：通过测量蛋白质的质量来研究其特性，包括串联质谱技术（MS/MS）用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。

2、试述如何应用2D-PAGE进行差异蛋白质组学的研究,并分析其优缺点。_百...

质谱技术MS：是目前分析蛋白质的主要手段之一。质谱技术可以检测蛋白质的质量、序列、修饰和定量等信息，包括基于母离子扫描MS和tandem MS（MS/MS）等多种方法。

双向聚丙烯酰胺凝胶电泳（2D-PAGE）2D-PAGE方法的应用始于20世纪70年代（OFarrell等，1975年），但迄今为止，它仍然是分离蛋白质的最有效的方法。

使用工具如KEGG、Reactome等，研究差异蛋白在生物通路中的角色。（2）识别受影响的生物通路或与特定疾病、功能相关的通路。互作网络分析：（1）利用如STRING、BioGRID等数据库，构建蛋白质之间的相互作用网络。

生物质谱 生物质谱技术是蛋白质组学研究中最重要的鉴定技术，其基本原理是样品分子离子化后，根据不同离子之间的荷质比（M/E）的差异来分离并确定分子量。

3、蛋白质组学样品前处理的方法

第二步： 蛋白裂解，因为蛋白被福尔马林或甲醇固定得非常紧了，有的人会选择加入水，让样品泡涨，我们更推荐加入裂解液（0.1M Tris-HCI， pH 0， 0.1M DTT），充分水化被固定的蛋白样品，然后匀浆和超声。 第三步： 水化之后，加入4%SDS。

等电点沉淀法 蛋白质等电点沉淀法是基于不同蛋白质离子具有不同等电点这一特性，依次改变溶液ph值的办法，将杂蛋白沉淀除去，最后获得目标产物。

与之前的ATGC方法把大肠癌分成四个型比起来，蛋白质组学的方法可以更精准地分成五个型。这也是蛋白质组学在精准医学领域一个很好的应用实例。

比如常规的分10个馏分，基本上可以鉴定到5000-8000个蛋白。

蛋白质样品的制备：蛋白质样品的制备是蛋白质组学研究的首要环节，也是最为重要的部分。蛋白质样品的质量直接影响到科学研究的真实性和可信度。

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