大家好，今天小编关注到一个比较有意思的话题，就是关于蛋白质组学的GO注释的问题，于是小编就整理了5个相关介绍蛋白质组学的GO注释的解答，让我们一起看看吧。

1. 蛋白质组学名词解释
2. 怎样对一组蛋白或基因做GO分析
3. 如何利用生物信息学研究一个蛋白分子
4. go分析是分析的差异蛋白还是全蛋白
5. 转录测序中的nr,nt,swissprot,cog,kegg,go分别是什么意思

1、蛋白质组学名词解释

蛋白质：是一类生物大分子，由一条或多条肽链组成，每条肽链都由一定数量的氨基酸按一定顺序通过肽键连接而成。

蛋白质组学（proteome）一词，源于蛋白质（protein）与 基因组（genome）两个词的杂合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。

蛋白质的一级结构是指蛋白质分子中从N端至C端的氨基酸排列顺序。蛋白质一级结构的形成与基因编码的氨基酸序列密切相关，是蛋白质结构和功能的基础。

科学家把研究生物体内多糖的科学叫做“糖生物学”，也有人沿袭“基因组学”和“蛋白质组学”的概念把这门学科叫做“糖原组学”。

计算、模拟）。生物信息学的主要研究方向：基因组学 - 蛋白质组学 - 系统生物学 - 比较基因组学，1989年在美国举办生物化学系统论与生物数学的计算机模型国际会议，生物信息学发展到了计算生物学、计算系统生物学的时代。

2、怎样对一组蛋白或基因做GO分析

三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号，而GO号可对于到Term，即功能类别或者细胞定位。

准备输入数据 待分析的数据就是一串基因名称了，可以是ensembl id、entrze id或者symbol id等类型都可以。把基因名称以一列的形式排开，放在一个文本文件中（例如命名“gene.txt”）。

Pathway功能分析及显著性判断 对差异表达基因进行Pathway功能分析，并计算Pvalue进行显著性判断，Pvalue越小，表明该pathway变化越显著，并可对每条Pathway通路图进行展示，同时在相应的位置标注差异表达基因。

你可以直接导入基因号和GO/KEGG编号的对应关系到R里面，然后用clusterProfiler进行数据分析” 。在如何构建的问题上，网上也有许多文章进行了介绍。构建 OrgDb 时，需要 gene_info 和 gene2go 。

GO富集的根本问题在于一个基因对应的GO term有多个，一个term对应多个gene，同时还有层级关系。这样导致如果一个term显著富集，那和它共享很多基因的term也会显著富集。

3、如何利用生物信息学研究一个蛋白分子

分子进化和比较基因组学，是最重要的课题之一 早期的工作主要是利用不同物种中同一种基因序列的异同来研究生物的进化，构建进化树。

蛋白质识别和鉴定蛋白质质谱是一种常用的方法，可以检测和鉴定蛋白质样品中的所有蛋白质分子。生物信息学方法可以对大量的质谱数据进行处理和分析，以鉴定不同样品中的相同或不同的蛋白质，并确定其序列、修饰和定量等信息。

基因序列分析 序列比对，生物信息学通过对比不同物种或个体的基因序列，揭示序列间的相似性和差异性，为物种分类、进化研究提供依据。

而在序列分析中， 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段，从序列的片段测定， 拼接， 基因的表达分析， 到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。

4、go分析是分析的差异蛋白还是全蛋白

当研究特定的生物过程、疾病或治疗方法时，经常需要分析在不同条件下表达的差异蛋白。

基因本体论富集分析（Gene 0ntology Enrichment Analysis） ： 这是最常用的富集分析类型，用于验基因集合中基因本体论（GO）目的富集情况。这可以帮助研究者了解基因集合中的基因在生物学过程、分子功能和细胞组成方面的共同特征。

分析对实验结果有提示的作用，通过差异基因的Pathway 分析，可以找到富集差异基因的Pathway 条目，寻找不同样品的差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关。

GO数据库在建立注释基因和蛋白质知识的标准词汇体系，使各数据库中基因产物功能描述相一致，随着研究的深入，基因本体语义词汇也在不断更新。Gene Ontology的分析，就是把你的基因的功能归类注释。

5、转录测序中的nr,nt,swissprot,cog,kegg,go分别是什么意思

基因功能的注释，使用的数据库包括NT/NR， SwissProt/TrEMbl， InterPro， KEGG， COG， Gene ontology等，使用比对的方法，如blast，找出同源相近的基因，并注释功能。

go富集分析是什么意思如下：富集分析（Enrichment Analysis） 是一种广泛应用于 生物信息学Q 研究的统计方法，主要用于检验一个基因集合中某些功能或特征的富集程度。

转录本是一个基因序列通过一种剪切后所得的能RNA。以前说转录本都是说表达蛋白的。现在LncRNA的研究多了，也说是一个转录本了。还有没有参考基因组序列的，一般是不可能去GO功能注释的。

并进行分类。（4） 调控序列和假基因的预测。基因功能的注释，使用的数据库包括NT/NR， SwissProt/TrEMbl， InterPro， KEGG， COG， Gene ontology等，使用比对的方法，如blast，找出同源相近的基因，并注释功能。

到此，以上就是小编对于蛋白质组学的GO注释的问题就介绍到这了，希望介绍关于蛋白质组学的GO注释的5点解答对大家有用。