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蛋白质组学序列测序-蛋白质序列测定的原理

蛋白质组学序列测序-蛋白质序列测定的原理

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  1. 怎么查找一个蛋白质的基因组序列
  2. 请教蛋白质质谱测序
  3. 蛋白质化学测序法原则程序课归纳为哪五个阶段
  4. 什么是蛋白质组学?

1、怎么查找一个蛋白质的基因组序列

网址中输入NCBI,点开NCBI主页。在主页的右上方有可选框,选择protein,后面输入蛋白名称,如果想具体找到的话,直接输入物种加蛋白,回车即可。打开NCBI主页。

首先打开官网,在搜索框前面的选择框中选择“gene”,在后面的搜索框中键入“CD47”,点击search。可以在弹出的新页面中查看搜索结果。你可以在这里看到各种相关基因的链接。这里选择单击CD47molecule[HomoSapiens(Human)。

到这个网页 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 在靠近最上方的下拉箭头,点击,选中Gene。然后在右侧的空格处输入基因的名称(英文). 点回车就可以了。

反过来,你知道蛋白质序列中有亮氨酸,但你却不知道亮氨酸到底是CUU、CUA、CUG、CUC这四个中谁编码的。所以根据氨基酸序列反推出来的基因序列有很多条。

2、请教蛋白质质谱测序

蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法 而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目,不一定要用到质谱技术 简单说,蛋白质测序的方法有很多,一般是在构建完成后,通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。

根据一级质谱可以测得多肽整体的分子量,多肽碎裂时会产生一系列在肽链不同位置断裂而形成的碎片离子,可以得到多肽的二级谱图,根据二级质谱相近谱峰之间的质量数之差可以推算出对应的氨基酸序列。

【答案】:利用Edman降解法、质谱法、酶降解法或其他方法测出多肽链的氨基酸的组成、数目及排列方式。

●1 样品必需纯(97%以上);●2 知道蛋白质的分子量;●3 知道蛋白质由几个亚基组成;●4 测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子量计算每种氨基酸的个数。●5 测定水解液中的氨量,计算酰胺的含量。

蛋白组学测序是研究蛋白质组成和功能的一种方法,对样本的要求主要包括以下几个方面:样本的纯度:为了获得准确和可靠的结果,样本应该尽可能纯净,避免其他污染物干扰。

3、蛋白质化学测序法原则程序课归纳为哪五个阶段

战略原则:将大化小,逐段分析,先后采用不同的方法制成两套肽片段,找出重叠的片段,排除肽段的前后位置,最后确定蛋白质的完整序列。1。测定蛋白质中的氨基酸组成。2。蛋白质N端和C端的测定。3。

编译程序把一个源程序翻译成目标程序的工作过程分为五个阶段:词法分析;语法分析;中间代码生成;代码优化;目标代码生成。编译程序的工作过程一般自始至终伴随进行信息表管理和出错处理两项工作。

羟胺(NH2OH)断裂 专一性断裂Asn-Gly之间的肽键。

所以测大的蛋白质的序列时,需要用化学试剂将蛋白质降解为一些肽段。即需要水解。水解时一般用三氟乙酸进行酸水解。酸水解就是加热酸进行水解,而碱水解就是加入碱进行水解。蛋白质一般用酸水解。

4、什么是蛋白质组学?

蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

概念 蛋白质组学是阐明生物体各种生物基因组在细胞中表达的全部蛋白质的表达模式及功能模式的学科;包括鉴定蛋白质的表达、存在方式(修饰形式)、结构、功能和相互作用等。

蛋白质组学研究的基本技术 对于蛋白质组学的研究来说,它的最基本的实验手段就是利用双向凝胶电泳(two-dimensional protein electrophoresis, 2DE),在整个 基因组水平上检测蛋白质表达的情况。

蛋白质:是一类生物大分子,由一条或多条肽链组成,每条肽链都由一定数量的氨基酸按一定顺序通过肽键连接而成。

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