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1. 蛋白质组学数据分析笔记说明
2. 蛋白质组学研究不同组织蛋白质的差异 常用那些技术或软件?
3. 关于质谱检测蛋白质的权威书籍 有哪些?? 谢谢
4. 能否推荐蛋白组学的经典书籍

1、蛋白质组学数据分析笔记说明

建立了基于QE，Fusion的DIA数据采集以及数据分析流程，实现了7500个蛋白的DIA定量分析。

大伙儿都知道，蛋白质组学（proteomics），是研究一种细胞或者一种生物体所表达的全部蛋白质。

将蛋白质组数据与其他组学数据（如转录组或代谢组数据）进行整合，从多层面理解差异蛋白的生物学含义。 生物标志物筛选 如果研究的目标是寻找疾病的生物标志物，进一步分析差异蛋白的诊断、预测和治疗价值。

分子）的关系。因此蛋白质组学的研究通常是高通量的。

实验设计建议 （1）方案一 —— 蛋白质组学 差异蛋白表达量验证 该思路是目前3~5分期刊中最常见的，也是最基础的一种研究思路。

2、蛋白质组学研究不同组织蛋白质的差异 常用那些技术或软件?

主要有两方面，一是结构蛋白质组学，二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面：① 针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞，建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群，即组成性蛋白质组学。

质谱技术MS：是目前分析蛋白质的主要手段之一。质谱技术可以检测蛋白质的质量、序列、修饰和定量等信息，包括基于母离子扫描MS和tandem MS（MS/MS）等多种方法。

酵母双杂交系统、抗体芯片、LCM技术、mic Solution Inc、SPR技术、色谱分离技术、双相电泳技术、有机质谱等等。LCM技术获得的细胞可以用于蛋白质样品的制备。蛋白质样品中的不同类型的蛋白质可以通过二维电泳进行分离。

蛋白质组学研究的基础技术主要包括以下两个方面：二维电泳 （2-DE）：二维电泳是一个用于分离蛋白质的技术，其中第一维度是按照蛋白质的等电点分离，而第二维度是按照蛋白质的分子量分离。

在应用2D-PAGE研究差异蛋白质组学问题时首先要获得要进行差异比较的组织，如肿瘤组织与癌旁正常组织，然后裂解组织和细胞，抑制蛋白酶活性，出去非蛋白质的DNA，RNA，脂类等物质，溶解蛋白质，溶解并抽提总蛋白质。

3、关于质谱检测蛋白质的权威书籍 有哪些?? 谢谢

这对于解析细胞内蛋白质间相互关系以及相关信号传导机制具有极其重要的意义。这一研究成果作为封面文章发布在9月6日的《科学信号》（Science Signaling）杂志上。 你可以去生物帮那里详细的了解。

所以建议：适量饮用，在我们大鱼大肉的期间，可以饮用弱碱性水（苏打水），来帮助我们中和胃酸，促进肠胃吸收。

如果我们把质荷比都算错了，我们是很难鉴定到正确的蛋白的。 下面这个图也能很直观地告诉我们质谱检测高分辨率的优势。

质谱分析技术在蛋白质组学研究领域和生物大分子研究领域中，是相当重要的分析技术。

Knecht等采用2-DE取得了3300个心肌蛋白条带，通过氨基酸序列分析、Edman降解法及基质辅助的激光解吸离子化质谱（MALDI-MS）等分析了其中150条。经活检及术后病理证实，有12条为扩张性心肌病特有的蛋白。

4、能否推荐蛋白组学的经典书籍

肿瘤与正常组织之间的蛋白质组差异对于癌症生物标志物的发现至关重要，但尚未在大型结肠癌肿瘤队列中进行系统表征。在这篇《Cell》文章中，报道了110例结肠癌患者的遗传、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学的综合信息。

《分子生物学实验技术》本书是关于分子生物学实验技术的一部综合性著作。

生物科技类：《基因：人类、生命和科学的革命》这本书对基因的基本概念和生物学进行了深入浅出的介绍。 《生物信息学：理论与应用》这本书介绍了生物信息学的基本原理和方法，包括基因组学、蛋白质组学、代谢组学等等。

① 技术创新性较高： 蛋白质组学技术起步相对晚，仍处在技术红利期中 ② 不一样的研究视角： 从DNA、mRNA到蛋白质，存在三个层次的调控，即转录水平调控，翻译水平调控，翻译后水平调控。

如果给你一批相似的数据，你能否写出20分 的文章？有太多的问题需要思考从本期开始，我们详细交流讨论多组学数据分析挖掘的问题。本周我们先看蛋白组学与蛋白糖基化的联合分析的文献。

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