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蛋白质组学需要做多久,蛋白质组学操作流程

蛋白质组学需要做多久,蛋白质组学操作流程

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  1. 做一单生物信息学分析需要多长时间
  2. 蛋白质组学的主要进展
  3. 蛋白质组学研究的主要步骤

1、做一单生物信息学分析需要多长时间

一个星期左右。如果学习操作时间足够,而且是基于别人写好的分析流程,估计几天就可以完成了,例如我们以细胞焦亡的纯生信分析为例:数据下载与整理。差异分析。进行肿瘤分型,并且进行生存分析。

分析外显子组只需半小 时, 30X 全基因组 8 小时。

差异分析:对不同样本之间的基因表达差异进行统计分析,找到与疾病、表型等相关的基因。生物信息学分析:利用各种生物信息学工具和数据库,进行进一步的分析和挖掘

生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播,分析和解释等各方面的学科,也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展,生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。

2、蛋白质组学的主要进展

在基础研究方面,近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域,如细胞生物学、神经生物学等。

一般来讲对蛋白质所作的改造包括增强酶蛋白的催化能力、稳定性、专一性以及改善酶蛋白质的反应条件等几个方面,已为其大规模的应用创造了条件。

本文将以肿瘤学为重点介绍基于MS技术的临床蛋白质组学的研究进展,对临床样品制备、蛋白定量检测方法、MS配置和数据分析进行详细叙述。此外,MS技术灵敏度不断提高,涌现出新形式的肿瘤特异性蛋白标志物如翻译后修饰和源于基因组畸变的变异。

主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面:① 针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。

3、蛋白质组学研究的主要步骤

在应用2D-PAGE研究差异蛋白质组学问题时首先要获得要进行差异比较的组织,如肿瘤组织与癌旁正常组织,然后裂解组织和细胞,抑制蛋白酶活性,出去非蛋白质的DNA,RNA,脂类等物质,溶解蛋白质,溶解并抽提总蛋白质。

蛋白质组学的基本技术流程主要为以下四方面:蛋白质标本的制备及分离:寻找较好的方法尽可能完全地抽提细胞或组织中的全部蛋白质是比较蛋白质组学研究的重要前提。

蛋白质组学的研究方法有蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质功能确定、蛋白质靶向定量技术。蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。

蛋白质组学的基本技术流程主要为以下四方面。

蛋白质组学的研究策略主要包括如下:质谱法:通过测量蛋白质的质量来研究其特性,包括串联质谱技术(MS/MS)用于确定蛋白质的氨基酸序列和翻译后修饰等信息。

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